RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613864.4

TARDBP-215, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 4

Gene TARDBP, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-215	ENST00000613864	CD7	P09564	240 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	SCT	P09683	121 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	MYL12A	P19105	171 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	SOCS1	O15524	211 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	CEL	P19835	753 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	EDN2	P20800	178 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	ST3GAL4	Q11206	333 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	PDPN	Q86YL7	162 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	DEFB125	Q8N687	156 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	BVES	Q8NE79	360 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	C5orf30	Q96GV9	206 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	AK3	Q9UIJ7	227 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		10.81	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	IRGM	A1A4Y4	181 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	BMPR1B	O00238	502 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	UBB	P0CG47	229 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	ZBTB25	P24278	435 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	TMEM50B	P56557	158 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	CD81	P60033	236 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	HLA-DRB3	P79483	266 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	RNLS	Q5VYX0	342 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	SETD6	Q8TBK2	473 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	USMG5	Q96IX5	58 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	TMEM68	Q96MH6	324 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	NEURL2	Q9BR09	285 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	S100A14	Q9HCY8	104 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864		Q9N2K0	584 aa		10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	OR2A4	O95047	310 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	CNIH1	O95406	144 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	APELA	P0DMC3	54 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	AADAC	P22760	399 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	ZNF45	Q02386	682 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	GFI1	Q99684	422 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		10.79	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	MSGN1	A6NI15	193 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864		M0R1X1	148 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	LGALS7	P47929	136 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	TAS2R43	P59537	309 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	RPEL1	Q2QD12	228 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	TMEM177	Q53S58	311 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	RDH8	Q9NYR8	311 aa		10.78	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
TARDBP-215	ENST00000613864	PRH1	P02810	166 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	CD3G	P09693	182 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	TATDN3	Q17R31	274 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	LAX1	Q8IWV1	398 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	SNAPC3	Q92966	411 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	COA4	Q9NYJ1	87 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	ZNF221	Q9UK13	617 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	HSF4	Q9ULV5	492 aa		10.77	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	OR11H12	B2RN74	326 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	AIRE	O43918	545 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	TPPP	O94811	219 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	APOA2	P02652	100 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	KIR2DS2	P43631	304 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	WNT4	P56705	351 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	10.76	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	10.76	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	PHYHIP	Q92561	330 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		10.76	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	TRDC	B7Z8K6	153 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	BPNT1	O95861	308 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	OR9G9	P0C7N8	305 aa		10.75	□□□□□ -0.69
TARDBP-215	ENST00000613864	SRM	P19623	302 aa		10.75	□□□□□ -0.69

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