RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 AKR1C3P42330 323 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R1AQ13522 171 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 TP53I3Q53FA7 332 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 C20orf196Q8IYI0 205 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 SUMF2Q8NBJ7 301 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 OR13C2Q8NGS9 318 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 OR8U1Q8NH10 309 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CORO2AQ92828 525 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 FOXB1Q99853 325 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 GINS3Q9BRX5 216 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 MSL2Q9HCI7 577 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CLN8Q9UBY8 286 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.46□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 K7EPK0 472 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 FSTL3O95633 263 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 PNMTP11086 282 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 RAB6AP20340 208 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 FXYD6P3P58550 94 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 SELENOTP62341 195 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 RAB11BQ15907 218 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ZNF101Q8IZC7 436 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 Q8N2B8 174 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 JAGN1Q8N5M9 183 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 NOXO1Q8NFA2 376 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 OR1P1Q8NH06 330 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 Q8WTZ3 238 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 TMEM18Q96B42 140 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 TVP23CQ96ET8 276 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 OR7D2Q96RA2 312 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ATG101Q9BSB4 218 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 HCAR1Q9BXC0 346 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CST11Q9H112 138 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ZNF702PQ9H963 129 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 GPR173Q9NS66 373 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 SIGLEC7Q9Y286 467 aa9.45□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 A0A1W2PPK0 400 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 TMEM235A6NFC5 223 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 TMEM212A6NML5 194 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CCSO14618 274 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 SFT2D2O95562 160 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 AMBPP02760 352 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 PF4P02776 101 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CST2P09228 141 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 QDPRP09417 244 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 PF4V1P10720 104 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ZNF43P17038 809 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 RPS26P62854 115 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 FUT5Q11128 374 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 TMEM128Q5BJH2 165 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 SPATA46Q5T0L3 261 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 LEMD1Q68G75 181 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 FDX2Q6P4F2 183 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 SLC35G3Q8N808 338 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 POC1AQ8NBT0 407 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CD300LFQ8TDQ1 290 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ABHD5Q8WTS1 349 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ORAOV1Q8WV07 137 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 TMEM106AQ96A25 262 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 MED20Q9H944 212 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 EDA2RQ9HAV5 297 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 GNG8Q9UK08 70 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 PKHD1P08F94 4074 aa9.44□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 A0A0U1RQV5 110 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 A6NIZ1 184 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 NKX6-3A6NJ46 265 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 DUXAA6NLW8 204 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CDC42EP2O14613 210 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 ZNF205O95201 554 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 TRGC2P03986 189 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 LIPFP07098 398 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 CXCL1P09341 107 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 PTHLHP12272 177 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 TNFRSF1AP19438 455 aa9.43□□□□□ -0.9
HCG18-241ENST00000602290 OR10J1P30954 320 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms