RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	LY6L	H3BQJ8	138 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPFF	O15130	113 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV1-69	P01742	117 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	TAS2R31	P59538	309 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	SP6	Q3SY56	376 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKAP14	Q86UN6	197 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	RPE	Q96AT9	228 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMR3A	Q99954	134 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	NAA60	Q9H7X0	242 aa		7.42	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	LEUTX	A8MZ59	168 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	CT45A6	P0DMU7	189 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	CT45A5	P0DMU8	189 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	CT45A7	P0DMV0	189 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	F2R	P25116	425 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	DHODH	Q02127	395 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	SSX2	Q16385	188 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCTD9	Q7L273	389 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	TP53RK	Q96S44	253 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD5L	O43866	347 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR5AC1	P0C628	307 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	MIDN	Q504T8	468 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	AJUBA	Q96IF1	538 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRR13	Q9NZ81	148 aa		7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A0A6YYJ9	748 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	C9orf170	A2RU37	121 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL5	P05113	134 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	CEACAM3	P40198	252 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	LYG2	Q86SG7	212 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF383	Q8NA42	475 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	PRAF2	O60831	178 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAMP3	O60896	148 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	EPHA1	P21709	976 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	GALNT14	Q96FL9	552 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	ALG5	Q9Y673	324 aa		7.4	□□□□□ -1.22
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		7.4	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		7.4	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	RNF212B	A8MTL3	300 aa		7.4	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CCNK	O75909	580 aa		7.4	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	IFNA2	P01563	188 aa		7.4	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CATR1	Q13166	79 aa		7.4	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		7.4	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	NANP	Q8TBE9	248 aa		7.4	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	DDB2	Q92466	427 aa		7.4	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	NABP2	Q9BQ15	211 aa		7.4	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1W2PPI3	338 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	C7orf66	A4D0T2	115 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576		H0Y980	276 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	RGS13	O14921	159 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	SFT2D2	O95562	160 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	THBS3	P49746	956 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	FCGR3B	O75015	233 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD99	P14209	185 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF585B	Q52M93	769 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	LIN54	Q6MZP7	749 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	MOB3B	Q86TA1	216 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	MALSU1	Q96EH3	234 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		7.39	□□□□□ -1.23
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		7.39	□□□□□ -1.23

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms