RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 IGKV1-13P0DP09 117 aa19■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa19■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 BRD3OSQ6XYD6 125 aa19■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC38A6Q8IZM9 456 aa19■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 OR8H3Q8N146 312 aa19■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 SECTM1Q8WVN6 248 aa19■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 TOMM40LQ969M1 308 aa19■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 ABHD14BQ96IU4 210 aa19■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PRD5 423 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PRF3 423 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PRM7 423 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 OR5H14A6NHG9 310 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 HSD17B6O14756 317 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 FBP1P09467 338 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 S100GP29377 79 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 ZFAND1Q8TCF1 268 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 PRDM13Q9H4Q3 707 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNRD1Q9P1U0 126 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF150Q9ULK6 438 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM96BQ9Y3D0 163 aa18.99■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 G3V4G9 280 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 IFITM3Q01628 133 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF251Q9BRH9 671 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 RSRP1Q9BUV0 290 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 SDHAF2Q9NX18 166 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 TBC1D24Q9ULP9 559 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 RNF114Q9Y508 228 aa18.98■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 PGAM2P15259 253 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 AANATQ16613 207 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 LDLRAD3Q86YD5 345 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 CMTM1Q8IZ96 169 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 DRAM1Q8N682 238 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 BVESQ8NE79 360 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 OR13C8Q8NGS7 320 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 ADTRPQ96IZ2 230 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 MEGF9Q9H1U4 602 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 COPZ2Q9P299 210 aa18.97■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A0U1RQK1 487 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR31O00270 319 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF66Q6ZN08 573 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 AJUBAQ96IF1 538 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 CCL28Q9NRJ3 127 aa18.96■□□□□ 0.63
CAPNS1-214ENST00000592483 IGLV2-14P01704 120 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
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CAPNS1-214ENST00000592483 DYNLT3P51808 116 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SSX2Q16385 188 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ZDHHC16Q969W1 377 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 DPAGT1Q9H3H5 408 aa18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 VGLL3A8MV65 326 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 M0R1X1 148 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 NDUFB6O95139 128 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC6A1P30531 599 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 BRS3P32247 399 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 THBS3P49746 956 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 RND3P61587 244 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 C2orf68Q2NKX9 166 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL39P5Q59GN2 51 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 MARCH1Q8TCQ1 289 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 MRGPRFQ96AM1 343 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 GPR132Q9UNW8 380 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 HILPDAQ9Y5L2 63 aa18.94■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A1W2PPI3 338 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 CATR1Q13166 79 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 DEFB112Q30KQ8 113 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ABCA11PQ4W5N1 156 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 POC5Q8NA72 575 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 MRAPQ8TCY5 172 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 CHIAQ9BZP6 476 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 TNFRSF19Q9NS68 423 aa18.93■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 PROP1O75360 226 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 MC5RP33032 325 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 DUTP33316 252 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 PROK1P58294 105 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 RPL15P61313 204 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 SAMD5Q5TGI4 173 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM86BQ8N661 226 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 LINC01006Q8NI28 216 aa18.92■□□□□ 0.62
CAPNS1-214ENST00000592483 ENKURQ8TC29 256 aa18.92■□□□□ 0.62
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