RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF137PP52743 207 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 OR9G1Q8NH87 305 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM133Q9H2Q1 129 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 NSG2Q9Y328 171 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 USF3Q68DE3 2245 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 FLNCQ14315 2725 aa18.62■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 DOCK11Q5JSL3 2073 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 TSC22D2O75157 780 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 S1PR2O95136 353 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 SCGB1D2O95969 90 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 HPRT1P00492 218 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 PAX1P15863 534 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 AKR1C2P52895 323 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 LINC00205P59089 165 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6ZRM9 215 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF767PQ75MW2 155 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 DMBX1Q8NFW5 382 aa18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 LOC105371242A0A075B767 164 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 BCL2L11O43521 198 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV2-5P01817 119 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGDIBP52566 201 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 OR2B11Q5JQS5 317 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF525Q8N782 197 aa18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF383Q8NA42 475 aa18.6■□□□□ 0.57
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CAPNS1-207ENST00000589146 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 MYO18BQ8IUG5 2567 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PPE2 198 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PR64 198 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1W2PRV1 198 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 M0R1W7 72 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 FCGR3BO75015 233 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 HKR1P10072 659 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 P2RY1P47900 373 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 TEX261Q6UWH6 196 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 ABHD12Q8N2K0 398 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM186Q96B77 213 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 CACNG5Q9UF02 275 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 U3KQ87 197 aa18.59■□□□□ 0.57
CAPNS1-207ENST00000589146 MSGN1A6NI15 193 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 A8MXK9 166 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM90A26D6RGX4 464 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CT45A6P0DMU7 189 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CT45A5P0DMU8 189 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 CT45A7P0DMV0 189 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 EPHA1P21709 976 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
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CAPNS1-207ENST00000589146 SLC51BQ86UW2 128 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXRED2Q8IWF2 684 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 OR4S2Q8NH73 311 aa18.58■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 LRBAP50851 2863 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PLA2G2AP14555 144 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 G6PCP35575 357 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR157Q5UAW9 335 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 KIR3DL3Q8N743 410 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 BEND2Q8NDZ0 799 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 OR8H1Q8NGG4 311 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 R3HDM4Q96D70 268 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNRD1Q9P1U0 126 aa18.57■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 NDUFS8O00217 210 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 TOR1AO14656 332 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNAB3O43448 404 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 KRASP01116 189 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 IGLV1-47P01700 117 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL12P30050 165 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 PRRX1P54821 245 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 LMO4P61968 165 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 Q8N7P7 452 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF680Q8NEM1 530 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10X1Q8NGY0 326 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 ARPC5LQ9BPX5 153 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 BPESC1Q9GZL8 116 aa18.56■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 A1L4Q6 167 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR137BO60478 399 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 RRASP10301 218 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 IL3RAP26951 378 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 POU2AF1Q16633 256 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 AARDQ4LEZ3 155 aa18.55■□□□□ 0.56
CAPNS1-207ENST00000589146 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa18.55■□□□□ 0.56
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