RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579466.1

MSI2-208, Transcript of musashi RNA binding protein 2, human

TSL 3

Gene MSI2, Length 186 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MSI2-208	ENST00000579466	CDH26	Q8IXH8	852 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	CYGB	Q8WWM9	190 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	HARBI1	Q96MB7	349 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	RNF5	Q99942	180 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	AK3	Q9UIJ7	227 aa		7.29	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466		A0A0A6YYD4	124 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466		A0A0B4J203	849 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	SOCS1	O15524	211 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	UBB	P0CG47	229 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	AADAC	P22760	399 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	TAS2R43	P59537	309 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	ST3GAL4	Q11206	333 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	TNXA	Q16473	311 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	AHSA2	Q719I0	299 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	PEMT	Q9UBM1	199 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	GHRL	Q9UBU3	117 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		7.28	□□□□□ -1.24
MSI2-208	ENST00000579466	OR11H12	B2RN74	326 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	SHOX	O15266	292 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	OR2A4	O95047	310 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	IGLV2-23	P01705	113 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	CD3G	P09693	182 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	P2RY14	Q15391	338 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	SNAPC3	Q92966	411 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	TM2D1	Q9BX74	207 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	OR2D2	Q9H210	308 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	S100A14	Q9HCY8	104 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	RDH8	Q9NYR8	311 aa		7.27	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	HERC2	O95714	4834 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	CXorf65	A6NEN9	183 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	MSGN1	A6NI15	193 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	PPP5D1	E7EU14	171 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	BMPR1B	O00238	502 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	ITGB1BP1	O14713	200 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	BET1	O15155	118 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	OR9G9	P0C7N8	305 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	WNT4	P56705	351 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	RHOG	P84095	191 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	CBX3	Q13185	183 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	ARHGAP5-AS1	Q96IT6	56 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466		Q9N2K0	584 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		7.26	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	ZNF785	A8K8V0	405 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	OR2J3	O76001	311 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	IGHV3-23	P01764	117 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	CRYGB	P07316	175 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	ATP5G2	Q06055	141 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	SETD9	Q8NE22	299 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	THRSP	Q92748	146 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	C5orf30	Q96GV9	206 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	USMG5	Q96IX5	58 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		7.25	□□□□□ -1.25
MSI2-208	ENST00000579466	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		7.25	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms