RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 ZBED5Q49AG3 693 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 OR2G6Q5TZ20 316 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 WDR82Q6UXN9 313 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 Q6ZN92 141 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 C19orf35Q6ZS72 473 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 OR2W3Q7Z3T1 314 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 LYPD6Q86Y78 171 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 SGPP2Q8IWX5 399 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 C10orf111Q8N326 155 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 FAM216BQ8N7L0 139 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 FAM86B1Q8N7N1 296 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 C19orf18Q8NEA5 215 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 OR10H4Q8NGA5 316 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 ANGPTL6Q8NI99 470 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF799Q96GE5 643 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 PPP1R36Q96LQ0 422 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 SELENOIQ9C0D9 397 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 NEK6Q9HC98 313 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 V9GY05 133 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 TANC2Q9HCD6 1990 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 hADV38S2A0JD32 116 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 FUOMA2VDF0 154 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 SMIM23A6NLE4 172 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 LEUTXA8MZ59 168 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 CCRL2O00421 344 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 CDIPTO14735 213 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 NDUFB2O95178 105 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 SERPINA1P01009 418 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 C1QCP02747 245 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF728P0DKX0 622 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 IFI30P13284 250 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 CTLA4P16410 223 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 GSSP48637 474 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 ERFP50548 548 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 SELENOTP62341 195 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 GRB2P62993 217 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 PRKCDQ05655 676 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 KLRD1Q13241 179 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 TRAM2Q15035 370 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 RFX4Q33E94 735 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 ABCA11PQ4W5N1 156 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 AGBL2Q5U5Z8 902 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 ZFAND6Q6FIF0 208 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 ERICH5Q6P6B1 374 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 CYP4Z1Q86W10 505 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 SBSPONQ8IVN8 264 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 MKXQ8IYA7 352 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 PNKDQ8N490 385 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 DRAM1Q8N682 238 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 CD177Q8N6Q3 437 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 OR2T27Q8NH04 317 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 OR51A7Q8NH64 312 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 NDNFQ8TB73 568 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 FAM81AQ8TBF8 368 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 SLC7A6Q92536 515 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 HIST1H4GQ99525 98 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 NRIP2Q9BQI9 281 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 PRSS27Q9BQR3 290 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 RERGLQ9H628 205 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 CD300AQ9UGN4 299 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 LGALS13Q9UHV8 139 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 ENPP5Q9UJA9 477 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 AP3M1Q9Y2T2 418 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 SERPINE3A8MV23 424 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 C17orf98A8MV24 154 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 ODF3BA8MYP8 253 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 FGF16O43320 207 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 NPPAP01160 153 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV3-23P01764 117 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 SLC2A5P22732 501 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 COX7A1P24310 79 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 IFNGR2P38484 337 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 GNG3P63215 75 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF92Q03936 586 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 DGUOKQ16854 277 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 SPANXN2Q5MJ10 180 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 UTF1Q5T230 341 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 LCE1FQ5T754 118 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 HCP5Q6MZN7 132 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF826PQ6ZT77 177 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 PRRC1Q96M27 445 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 GAFA1Q96PS6 74 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
PTPRM-208ENST00000578600 EBF4Q9BQW3 602 aa3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms