RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578348.5

GGA3-205, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-205ENST00000578348 TMEM210A6NLX4 147 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-205ENST00000578348 KLK10O43240 276 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-205ENST00000578348 IFNA1P01562 189 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-205ENST00000578348 IGKV1D-33P01593 117 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-205ENST00000578348 IGKV1-33P01594 117 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-205ENST00000578348 PGA5P0DJD9 388 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-205ENST00000578348 P2RY6Q15077 328 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-205ENST00000578348 ADIRFQ15847 76 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-205ENST00000578348 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-205ENST00000578348 SCCPDHQ8NBX0 429 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-205ENST00000578348 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-205ENST00000578348 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GGA3-205ENST00000578348 SNX22Q96L94 193 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-205ENST00000578348 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-205ENST00000578348 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa9.59□□□□□ -0.87
GGA3-205ENST00000578348 A0A087X0M5 115 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 A0A1B0GX30 115 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OR5H1A6NKK0 313 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CDIPTO14735 213 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 AGFG2O95081 481 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CGAP01215 116 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 PAX1P15863 534 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 PSG7Q13046 419 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 STARD4Q96DR4 205 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 NEU1Q99519 415 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CACNA1GO43497 2377 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 RAMP3O60896 148 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 NXPH2O95156 264 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 KRASP01116 189 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 IGLV1-44P01699 117 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CRYABP02511 175 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OPN1MWP04001 364 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CD55P08174 381 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OPN1MW2P0DN77 364 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OPN1MW3P0DN78 364 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ERVK11-1P61568 191 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 SEM1Q6ZVN7 128 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 NECAP1Q8NC96 275 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 SLC25A22Q9H936 323 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.58□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CECR9P0C854 216 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 SFTPCP11686 197 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 G6PCP35575 357 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 MPV17P39210 176 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 TNFRSF9Q07011 255 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ALKBH6Q3KRA9 238 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 FAM169BQ8N8A8 192 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 MKRN2OSH3BPM6 223 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 C1orf185Q5T7R7 199 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ACSM6Q6P461 480 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OR2D2Q9H210 308 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CLN8Q9UBY8 286 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 NAT8Q9UHE5 227 aa9.57□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 RNF212BA8MTL3 300 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 SH2D1BO14796 132 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 PHOX2AO14813 284 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 TGOLN2O43493 480 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 GRPP07492 148 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 KITLGP21583 273 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 RPS16P62249 146 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 GAMTQ14353 236 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 C16orf82Q7Z2V1 217 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OR5R1Q8NH85 324 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 GAB2Q9UQC2 676 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 FAM90A26D6RGX4 464 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ZNF146Q15072 292 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 TMEM241Q24JQ0 296 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 ZNF645Q8N7E2 425 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OR10A7Q8NGE5 316 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 OR1L1Q8NH94 360 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 CXXC4Q9H2H0 198 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 WIPI2Q9Y4P8 454 aa9.56□□□□□ -0.88
GGA3-205ENST00000578348 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.5 ms