RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 CT45A6P0DMU7 189 aa15.48■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 CT45A5P0DMU8 189 aa15.48■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 CT45A7P0DMV0 189 aa15.48■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 PAX6P26367 422 aa15.48■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 LINC00205P59089 165 aa15.48■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 TAS2R31P59538 309 aa15.48■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 CATR1Q13166 79 aa15.48■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 SLC25A42Q86VD7 318 aa15.48■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 DYNAPQ8N1N2 210 aa15.48■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 MINDY2Q8NBR6 621 aa15.48■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 OR51H1Q8NH63 302 aa15.48■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 BEX2Q9BXY8 128 aa15.48■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 BEX1Q9HBH7 125 aa15.48■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 TMEM160Q9NX00 188 aa15.48■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 RNF212BA8MTL3 300 aa15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 OOSP1A8MZH6 123 aa15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 PEX14O75381 377 aa15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 HNF1AP20823 631 aa15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 THBS3P49746 956 aa15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 RPL30P62888 115 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 TMEM128Q5BJH2 165 aa15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 KCTD9Q7L273 389 aa15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 CAPSLQ8WWF8 208 aa15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 ADTRPQ96IZ2 230 aa15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 NABP2Q9BQ15 211 aa15.47■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 A0A0U1RQK1 487 aa15.46■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa15.46■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa15.46■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 MOB3BQ86TA1 216 aa15.46■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 SGPP2Q8IWX5 399 aa15.46■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 OR8H3Q8N146 312 aa15.46■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 NAA60Q9H7X0 242 aa15.46■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 FAM96BQ9Y3D0 163 aa15.46■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 PLXNB1O43157 2135 aa15.46■□□□□ 0.07
CTU2-204ENST00000564105 TNCP24821 2201 aa15.46■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 A0A1W2PPI3 338 aa15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 OR4E1P0C645 316 aa15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 VSIG10L2P0DP72 767 aa15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 F2RP25116 425 aa15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 SRP14P37108 136 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 MECP2P51608 486 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 RAG2P55895 527 aa15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 DHODHQ02127 395 aa15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 ZNF383Q8NA42 475 aa15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 PPP1R1AQ13522 171 aa15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 C9orf139Q6ZV77 190 aa15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 C22orf15Q8WYQ4 148 aa15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 DDB2Q92466 427 aa15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa15.45■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa15.44■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 TIMM23O14925 209 aa15.44■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 DHFRP00374 187 aa15.44■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 FBP1P09467 338 aa15.44■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 VAMP1P23763 118 aa15.44■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 C4orf46Q504U0 113 aa15.44■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 OR2B11Q5JQS5 317 aa15.44■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 C11orf88Q6PI97 169 aa15.44■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 OR5AN1Q8NGI8 311 aa15.44■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 MEGF9Q9H1U4 602 aa15.44■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa15.44■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa15.43■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 H0YJW9 148 aa15.43■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 APOA2P02652 100 aa15.43■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 OR5AC1P0C628 307 aa15.43■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 ARHGDIBP52566 201 aa15.43■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 SPAG16Q8N0X2 631 aa15.43■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 GALNT14Q96FL9 552 aa15.43■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 TP53RKQ96S44 253 aa15.43■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 SLC35D1Q9NTN3 355 aa15.43■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 H0Y980 276 aa15.42■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 FCGR3BO75015 233 aa15.42■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 SFT2D2O95562 160 aa15.42■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 MC5RP33032 325 aa15.42■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 SLC9A3R2Q15599 337 aa15.42■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 SP6Q3SY56 376 aa15.42■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 LYG2Q86SG7 212 aa15.42■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa15.42■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 OR52B4Q8NGK2 314 aa15.42■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 CFHR4Q92496 578 aa15.42■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 C9orf170A2RU37 121 aa15.41■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 H7C2Y5 167 aa15.41■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 PRAF2O60831 178 aa15.41■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 IL5P05113 134 aa15.41■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 ANXA3P12429 323 aa15.41■□□□□ 0.06
CTU2-204ENST00000564105 KIR2DS2P43631 304 aa15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms