RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2D2	Q9H210	308 aa		16.94	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	16.94	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SPDEF	O95238	335 aa		16.93	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ARFRP1	Q13795	201 aa		16.93	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	CDNF	Q49AH0	187 aa		16.93	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM65	Q6PI78	240 aa		16.93	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	DAPK2	Q9UIK4	370 aa		16.93	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	DTYMK	P23919	212 aa		16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SDC2	P34741	201 aa		16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	TALDO1	P37837	337 aa		16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	PLGLA	Q15195	96 aa		16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ECSCR	Q19T08	205 aa		16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	HACD4	Q5VWC8	232 aa		16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	OR11H1	Q8NG94	326 aa		16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	DPF1	Q92782	380 aa		16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	VSIG4	Q9Y279	399 aa		16.92	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	APOA2	P02652	100 aa		16.91	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB25	P57735	213 aa		16.91	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	16.91	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		16.91	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	16.91	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPO	Q9BU64	300 aa		16.91	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		16.91	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	16.91	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	TNC	P24821	2201 aa		16.91	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	CA2	P00918	260 aa		16.9	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLV2-23	P01705	113 aa		16.9	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	16.9	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		16.9	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		16.9	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	CLCC1	Q96S66	551 aa		16.9	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	16.9	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		16.9	■□□□□ 0.3
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1W2PN81	502 aa		16.89	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	CRYGB	P07316	175 aa		16.89	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC2L	P0C7M8	214 aa		16.89	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	CHRNA7	P36544	502 aa		16.89	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	GNB1	P62873	340 aa		16.89	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		16.89	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		16.89	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	GINS4	Q9BRT9	223 aa		16.89	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		16.89	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		16.89	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A17	O43808	307 aa		16.88	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	SCGN	O76038	276 aa		16.88	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	CD36	P16671	472 aa		16.88	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	16.88	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	MXD1	Q05195	221 aa		16.88	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	16.88	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	NEDD8	Q15843	81 aa		16.88	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		16.88	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		16.88	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		16.88	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	DDB2	Q92466	427 aa		16.88	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		16.88	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM235	A6NFC5	223 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	SSX5	O60225	188 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	LGALS7	P47929	136 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	SCAND1	P57086	179 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM177	Q53S58	311 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTBL2	Q562R1	376 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	LFNG	Q8NES3	379 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5B12	Q96R08	314 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	SCOC	Q9UIL1	159 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	PITPNA	Q00169	270 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF616	Q08AN1	781 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	ARPC1A	Q92747	370 aa		16.87	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	SORL1	Q92673	2214 aa		16.86	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00473	A8K010	186 aa		16.86	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		16.86	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8U8	P0C7N1	319 aa		16.86	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	DGCR2	P98153	550 aa		16.86	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		16.86	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	FXYD3	Q14802	87 aa		16.86	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		16.86	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		16.86	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	BVES	Q8NE79	360 aa		16.86	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	16.86	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	16.86	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	16.86	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	ETV7	Q9Y603	341 aa		16.86	■□□□□ 0.29
PPP4C-205	ENST00000563200	CTXN2	P0C2S0	81 aa		16.85	■□□□□ 0.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms