RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 GINS1Q14691 196 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 SSX6Q7RTT6 188 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 PP6455Q8WZ26 134 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 CMTM5Q96DZ9 223 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 APOL4Q9BPW4 351 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 REEP1Q9H902 201 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 HSPG2P98160 4391 aa6.33□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 SH2D1BO14796 132 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 SYT7O43581 403 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 SOX15O60248 233 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYB5AP00167 134 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 VHLP40337 213 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 REG1BP48304 166 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 NDPQ00604 133 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 UTS2BQ765I0 119 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRSS35Q8N3Z0 413 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00311Q8N616 119 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 MINDY2Q8NBR6 621 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 MBOAT4Q96T53 435 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 RHOFQ9HBH0 211 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 RETNQ9HD89 108 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIF25Q9UIL4 384 aa6.32□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 HERC1Q15751 4861 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1W2PPE3 182 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC01619G3V211 115 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 G3V318 75 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 H3BSH0 61 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 MOSP00540 346 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 HLA-DRB1P01911 266 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 MT-ND2P03891 347 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 HMGN1P05114 100 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF44P15621 663 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 CNTFRP26992 372 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 CD1BP29016 333 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 HTR1FP30939 366 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM106AQ96A25 262 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPSB1Q96BD6 273 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 OPALINQ96PE5 141 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5B12Q96R08 314 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLN6Q9NWW5 311 aa6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 C15orf65H3BRN8 121 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRKYO43930 277 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAB9AP51151 201 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP1B3P54709 279 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTCP1P56278 107 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 CBX1P83916 185 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 BNIP1Q12981 228 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 AADACL4Q5VUY2 407 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM236Q5W0B7 351 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 MOB3BQ86TA1 216 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 HS3ST5Q8IZT8 346 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 GIPC3Q8TF64 312 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 RFT1Q96AA3 541 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00479Q96M42 142 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 NABP2Q9BQ15 211 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.3□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 H0YJX3 145 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 M0R129 80 aa6.29□□□□□ -1.4
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC31A2O15432 143 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms