RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559834.1

HDDC3-204, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene HDDC3, Length 1,076 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-204ENST00000559834 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa7.01□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 OR1A1Q9P1Q5 309 aa7.01□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 AK3Q9UIJ7 227 aa7.01□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 HSF4Q9ULV5 492 aa7.01□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 A0A0B4J203 849 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 TRDCB7Z8K6 153 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 M0R1X1 148 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 SOCS1O15524 211 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 AIREO43918 545 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 PROP1O75360 226 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 JTBO76095 146 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 SCTP09683 121 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 CD37P11049 281 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 QRFPP83859 136 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 UNC119Q13432 240 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 RPEL1Q2QD12 228 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 ZNF343Q6P1L6 599 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 IL34Q6ZMJ4 242 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 FAM89BQ8N5H3 189 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 OR2K2Q8NGT1 345 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 SNAPC3Q92966 411 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 MND1Q9BWT6 205 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 LPAR5Q9H1C0 372 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 C12orf4Q9NQ89 552 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 RDH8Q9NYR8 311 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 PEMTQ9UBM1 199 aa7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 TNCP24821 2201 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 SHISA3A0PJX4 238 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 SHOXO15266 292 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 OR2A4O95047 310 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 CSN3P07498 182 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 RRASP10301 218 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 LINC00205P59089 165 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 TPBGQ13641 420 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 INSL4Q14641 139 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 SPHARQ15513 63 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 RNLSQ5VYX0 342 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 BVESQ8NE79 360 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 PHB2Q99623 299 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 CENPOQ9BU64 300 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 PLGRKTQ9HBL7 147 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 COA4Q9NYJ1 87 aa6.99□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 A0A0A6YYD4 124 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 MSGN1A6NI15 193 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 SLC17A2O00624 439 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 IGLV2-23P01705 113 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 CRYGBP07316 175 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 UCHL1P09936 223 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 PSMD7P51665 324 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 P2RY14Q15391 338 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 RTL8BQ17RB0 113 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 LAX1Q8IWV1 398 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 TEX45Q8NA69 505 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 HARBI1Q96MB7 349 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 PECRQ9BY49 303 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 KCNK15Q9H427 330 aa6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 PTGES3LE9PB15 166 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 MPPED1O15442 326 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 FABP7O15540 132 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 ARL6IP5O75915 188 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 ACTL6BO94805 426 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 TPPPO94811 219 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 DIRAS3O95661 229 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 CDK1P06493 297 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 GNAO1P09471 354 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 CD3GP09693 182 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 OR9G9P0C7N8 305 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 TMEM50BP56557 158 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 ATP5G2Q06055 141 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 DYRK1AQ13627 763 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 MED22Q15528 200 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 TRAM1Q15629 374 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 RAB11BQ15907 218 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 TMEM177Q53S58 311 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 FAM209BQ5JX69 171 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 UFD1Q92890 307 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 OR2D2Q9H210 308 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.97□□□□□ -1.29
HDDC3-204ENST00000559834 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms