RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559460.5

SMAD3-211, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-211ENST00000559460 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 FRZBQ92765 325 aa7.06□□□□□ -1.28
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SMAD3-211ENST00000559460 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.06□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
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SMAD3-211ENST00000559460 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.05□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.04□□□□□ -1.28
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SMAD3-211ENST00000559460 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.04□□□□□ -1.28
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SMAD3-211ENST00000559460 NSL1Q96IY1 281 aa7.04□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 HARBI1Q96MB7 349 aa7.04□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.04□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.04□□□□□ -1.28
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SMAD3-211ENST00000559460 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.03□□□□□ -1.28
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SMAD3-211ENST00000559460 DPPA5A6NC42 116 aa7.03□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 M0R129 80 aa7.03□□□□□ -1.28
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SMAD3-211ENST00000559460 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 AADACL4Q5VUY2 407 aa7.03□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 ASCL4Q6XD76 172 aa7.03□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.03□□□□□ -1.28
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SMAD3-211ENST00000559460 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.03□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 SPIN2AQ99865 258 aa7.03□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa7.03□□□□□ -1.28
SMAD3-211ENST00000559460 NICN1Q9BSH3 213 aa7.03□□□□□ -1.28
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SMAD3-211ENST00000559460 RAP2AP10114 183 aa7.02□□□□□ -1.29
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SMAD3-211ENST00000559460 GNGT1P63211 74 aa7.02□□□□□ -1.29
SMAD3-211ENST00000559460 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
SMAD3-211ENST00000559460 VMA21Q3ZAQ7 101 aa7.02□□□□□ -1.29
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SMAD3-211ENST00000559460 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
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SMAD3-211ENST00000559460 PKD1P98161 4303 aa7.02□□□□□ -1.29
SMAD3-211ENST00000559460 DAPL1A0PJW8 107 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD3-211ENST00000559460 DHFRP00374 187 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD3-211ENST00000559460 CD74P04233 296 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD3-211ENST00000559460 GLAP06280 429 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD3-211ENST00000559460 CD2P06729 351 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD3-211ENST00000559460 C8orf88P0DMB2 117 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD3-211ENST00000559460 PRKACGP22612 351 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD3-211ENST00000559460 PRDX6P30041 224 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD3-211ENST00000559460 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SMAD3-211ENST00000559460 ZNF529Q6P280 563 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD3-211ENST00000559460 FDX2Q6P4F2 183 aa7.01□□□□□ -1.29
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