RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 LDLRAD4O15165 306 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 PROP1O75360 226 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 ARL6IP5O75915 188 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 SPDEFO95238 335 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 CA2P00918 260 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 APOA2P02652 100 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 IGKV1-16P04430 117 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 LGALS7P47929 136 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 HLA-DRB3P79483 266 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 RAB11BQ15907 218 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 PDPNQ86YL7 162 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 ZNF383Q8NA42 475 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 OR5T1Q8NG75 326 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 UFD1Q92890 307 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 TMEM68Q96MH6 324 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 KCNK15Q9H427 330 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.27□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 H0Y980 276 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 M0R1X1 148 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 SLC25A17O43808 307 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 IGLV1-51P01701 117 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 HSMCR30P0CW71 290 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 SERPINB10P48595 397 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 VEGFCP49767 419 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 PSMD7P51665 324 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 TMEM50BP56557 158 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 LINC00205P59089 165 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 CBX3Q13185 183 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 TATDN3Q17R31 274 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 Q8N1Y9 231 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 POC5Q8NA72 575 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 PECRQ9BY49 303 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 RDH8Q9NYR8 311 aa6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 A8MZ25 164 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 BET1O15155 118 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 CD3GP09693 182 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 AADACP22760 399 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 TPBGQ13641 420 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 TRAM1Q15629 374 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 USMG5Q96IX5 58 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 CENPOQ9BU64 300 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 RAB22AQ9UL26 194 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 V9GY05 133 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.25□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 RYR3Q15413 4870 aa6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 MSGN1A6NI15 193 aa6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 SHOXO15266 292 aa6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 FABP7O15540 132 aa6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 RGS10O43665 173 aa6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 BRI3O95415 125 aa6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 IGLV2-23P01705 113 aa6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 RRASP10301 218 aa6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 CLDN12P56749 244 aa6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 SYNJ2BPP57105 145 aa6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 IRF3Q14653 427 aa6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 RTL8BQ17RB0 113 aa6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.24□□□□□ -1.41
COCH-211ENST00000557065 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.24□□□□□ -1.41
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