RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 HERPUD1Q15011 391 aa6.82□□□□□ -1.32
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PTPRB-209ENST00000550857 C18orf12Q96KH6 178 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 KCNK15Q9H427 330 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.82□□□□□ -1.32
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PTPRB-209ENST00000550857 LAX1Q8IWV1 398 aa6.82□□□□□ -1.32
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PTPRB-209ENST00000550857 IGHV1-46P01743 117 aa6.82□□□□□ -1.32
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PTPRB-209ENST00000550857 AGPAT2O15120 278 aa6.82□□□□□ -1.32
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PTPRB-209ENST00000550857 SVBPQ8N300 66 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 IFT22Q9H7X7 185 aa6.82□□□□□ -1.32
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PTPRB-209ENST00000550857 PSPNO60542 156 aa6.81□□□□□ -1.32
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PTPRB-209ENST00000550857 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.81□□□□□ -1.32
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PTPRB-209ENST00000550857 PGPA6NDG6 321 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF727A8MUV8 499 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 SAP30O75446 220 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 OR9G9P0C7N8 305 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 APOC4P55056 127 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF154Q13106 437 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 GAPTQ8N292 157 aa6.81□□□□□ -1.32
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PTPRB-209ENST00000550857 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 PRTN3P24158 256 aa6.81□□□□□ -1.32
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PTPRB-209ENST00000550857 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.81□□□□□ -1.32
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PTPRB-209ENST00000550857 YPEL2Q96QA6 119 aa6.81□□□□□ -1.32
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PTPRB-209ENST00000550857 GHRHP01286 108 aa6.8□□□□□ -1.32
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PTPRB-209ENST00000550857 FOXL2P58012 376 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 BTN1A1Q13410 526 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 OPCMLQ14982 345 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 WDR73Q6P4I2 378 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRB-209ENST00000550857 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
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