RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 HRASP01112 189 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 IGLV2-14P01704 120 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 IGHV3-7P01780 117 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SERPINE2P07093 398 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 OR4E1P0C645 316 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 FAM106CPP0CH98 169 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 CD1BP29016 333 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SAA4P35542 130 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 BAMBIQ13145 260 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 CADM3Q8N126 398 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 OR4S2Q8NH73 311 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 IL22RA2Q969J5 263 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 PHB2Q99623 299 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 MEGF9Q9H1U4 602 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SHPKQ9UHJ6 478 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 WASHC3Q9Y3C0 194 aa7.55□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SFT2D2O95562 160 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 HPRT1P00492 218 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 CT45A6P0DMU7 189 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 CT45A5P0DMU8 189 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 CT45A7P0DMV0 189 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 VAMP1P23763 118 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 LGALS7P47929 136 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 KLRD1Q13241 179 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SSX2Q16385 188 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 RPL39P5Q59GN2 51 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 LYG2Q86SG7 212 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 MOB3BQ86TA1 216 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 LGI3Q8N145 548 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 OR4C13Q8NGP0 309 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 OR5R1Q8NH85 324 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 NABP2Q9BQ15 211 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 BEX2Q9BXY8 128 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 TMEM222Q9H0R3 208 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 PLEKHA2Q9HB19 425 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 C1RLQ9NZP8 487 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 COMMD9Q9P000 198 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.54□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 BTBD17A6NE02 478 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 H7C2Y5 167 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 CDS2O95674 445 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 AVPP01185 164 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 FGF2P09038 288 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 PI3P19957 117 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 UCP1P25874 307 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 ERVK-16P61578 105 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 DHRS2Q13268 280 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 FAM219AQ8IW50 185 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 LRTM2Q8N967 370 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 ZNF383Q8NA42 475 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 OR2T10Q8NGZ9 312 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 OR51H1Q8NH63 302 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 DDB2Q92466 427 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 TMEM56Q96MV1 263 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 SLC35D1Q9NTN3 355 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 ACANP16112 2415 aa7.53□□□□□ -1.2
CS-220ENST00000550700 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PPI3 338 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 C9orf170A2RU37 121 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 C7orf66A4D0T2 115 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 H0YJW9 148 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 TNFSF12O43508 249 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 FCGR3BO75015 233 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 PROP1O75360 226 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 SPDEFO95238 335 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 LY6G6DO95868 133 aa7.52□□□□□ -1.21
CS-220ENST00000550700 MOSP00540 346 aa7.52□□□□□ -1.21
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