RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549484.5

DUXAP9-202, Transcript of double homeobox A pseudogene 9, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene DUXAP9, Length 596 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUXAP9-202ENST00000549484 PSG5Q15238 335 aa8.78□□□□□ -1
DUXAP9-202ENST00000549484 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
DUXAP9-202ENST00000549484 PDPNQ86YL7 162 aa8.78□□□□□ -1
DUXAP9-202ENST00000549484 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
DUXAP9-202ENST00000549484 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.78□□□□□ -1
DUXAP9-202ENST00000549484 YIPF6Q96EC8 236 aa8.78□□□□□ -1
DUXAP9-202ENST00000549484 P2RX4Q99571 388 aa8.78□□□□□ -1
DUXAP9-202ENST00000549484 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
DUXAP9-202ENST00000549484 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.78□□□□□ -1
DUXAP9-202ENST00000549484 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.78□□□□□ -1
DUXAP9-202ENST00000549484 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.78□□□□□ -1
DUXAP9-202ENST00000549484 GAB2Q9UQC2 676 aa8.78□□□□□ -1
DUXAP9-202ENST00000549484 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
DUXAP9-202ENST00000549484 ETV7Q9Y603 341 aa8.78□□□□□ -1
DUXAP9-202ENST00000549484 A0A1W2PN81 502 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 J3QRK9 145 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 CCL24O00175 119 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 SLC25A17O43808 307 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 AIREO43918 545 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 CHRNA7P36544 502 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 MYCNOSP40205 109 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 SCAND1P57086 179 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 RAB25P57735 213 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 CX3CL1P78423 397 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 KLK15Q9H2R5 256 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 GNB4Q9HAV0 340 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 COL7A1Q02388 2944 aa8.77□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 TRAV18A0A075B6X5 111 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 LINC00473A8K010 186 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 SOX15O60248 233 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 SPDEFO95238 335 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 IGLV1-40P01703 118 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 IGLV2-23P01705 113 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 PTHLHP12272 177 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 PITPNAQ00169 270 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 TMEM65Q6PI78 240 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 REC114Q7Z4M0 266 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 GVQW1Q8N7I0 195 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 BVESQ8NE79 360 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 MRAPQ8TCY5 172 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 HARBI1Q96MB7 349 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 OR5B12Q96R08 314 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 RNF5Q99942 180 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 DCSTAMPQ9H295 470 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.76□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 TNCP24821 2201 aa8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 FCER2P06734 321 aa8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 RPS19P39019 145 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 KRTAP10-11P60412 298 aa8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 ZNF645Q8N7E2 425 aa8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 DDB2Q92466 427 aa8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 ARPC1AQ92747 370 aa8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 SPATA2Q9UM82 520 aa8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.75□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 MEIS3P1A6NDR6 274 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 I3L521 148 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 SHOXO15266 292 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 CRYZL1O95825 349 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 CTXN2P0C2S0 81 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 RAB9AP51151 201 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 NCS1P62166 190 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 GNB1P62873 340 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 CBX3Q13185 183 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 FHL3Q13643 280 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 RTL8BQ17RB0 113 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 TMEM177Q53S58 311 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 UBE2NLQ5JXB2 153 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 CNIH2Q6PI25 160 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 LFNGQ8NES3 379 aa8.74□□□□□ -1.01
DUXAP9-202ENST00000549484 BEST4Q8NFU0 473 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.9 ms