RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 LYL1P12980 280 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 UBA52P62987 128 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 HNF4GQ14541 408 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 IL22RA2Q969J5 263 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 S1PR3Q99500 378 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 RAB9BQ9NP90 201 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GU03 582 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 NMBP08949 121 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 OR2B8PP59922 312 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ID3Q02535 119 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ZFP57Q9NU63 452 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 B3GALNT1O75752 331 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 PPOXP50336 477 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 RAB7AP51149 207 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TIMD4Q96H15 378 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TNCP24821 2201 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 IGSF23A1L1A6 192 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 NDUFA2O43678 99 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CLLU1Q5K131 121 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 COMMD7Q86VX2 200 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 PDZD9Q8IXQ8 264 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 R3HDM4Q96D70 268 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 HCFC1P51610 2035 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 A1L4Q6 167 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 A6NNC1 897 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 H7C2Y5 167 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TXNL1O43396 289 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 SYNGR2O43760 224 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 IGKV1-16P04430 117 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 P2RY1P47900 373 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CORO2AQ92828 525 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 RAB1CQ92928 201 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 WFDC1Q9HC57 220 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.91□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 GPR137BO60478 399 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 PITX3O75364 302 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 IFNA17P01571 189 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 IGHV2-70P01814 119 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 OPN1MWP04001 364 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 AGAP20933 346 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 COX7A1P24310 79 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 MSMO1Q15800 293 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ZNF383Q8NA42 475 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 RFNGQ9Y644 331 aa6.9□□□□□ -1.3
CS-215ENST00000549143 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 LEUTXA8MZ59 168 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 PAX9P55771 341 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 UBE2KP61086 200 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 ARF6P62330 175 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 ZNF843Q8N446 348 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 RHOVQ96L33 236 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 OR8B2Q96RD0 313 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 ZNF251Q9BRH9 671 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 HINT2Q9BX68 163 aa6.9□□□□□ -1.31
CS-215ENST00000549143 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.9□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.5 ms