RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-208	ENST00000546997	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	PRO1933	Q9H354	126 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	VAX2	Q9UIW0	290 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	DFFB	O76075	338 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CLDN14	O95500	239 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	NPBWR2	P48146	333 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	GPM6A	P51674	278 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	PMS2P11	Q13670	270 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	ACY3	Q96HD9	319 aa		13.85	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	TRDC	B7Z8K6	153 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	SP6	Q3SY56	376 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	NINJ1	Q92982	152 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM56	Q96MV1	263 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	LIME1	Q9H400	295 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	IGSF23	A1L1A6	192 aa		13.83	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		13.83	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	PDCD6	O75340	191 aa		13.83	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CA6	P23280	308 aa		13.83	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	GLRX	P35754	106 aa		13.83	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	PDLIM4	P50479	330 aa		13.83	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		13.83	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		13.83	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	LRP11	Q86VZ4	500 aa		13.83	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		13.83	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	RNF150	Q9ULK6	438 aa		13.83	□□□□□ -0.19
BRF1-208	ENST00000546997	CACNA1D	Q01668	2161 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	SIAH2	O43255	324 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	TUBG1	P23258	451 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	TAS2R30	P59541	319 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	IL24	Q13007	206 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	PDCD1	Q15116	288 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	BATF2	Q8N1L9	274 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	TOMM40L	Q969M1	308 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	NGB	Q9NPG2	151 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		13.83	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997		A0A1B0GV50	99 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	TK1	P04183	234 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	BCL3	P20749	454 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FUT3	P21217	361 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	KITLG	P21583	273 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	GCH1	P30793	250 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	SLC35G3	Q8N808	338 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	OR1P1	Q8NH06	330 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	DYRK2	Q92630	601 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	AMBP	P02760	352 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	PGA5	P0DJD9	388 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	VAMP2	P63027	116 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	NUP37	Q8NFH4	326 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	DUSP13	Q9UII6	198 aa		13.82	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		13.81	□□□□□ -0.2
BRF1-208	ENST00000546997	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		13.81	□□□□□ -0.2

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