RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 A0A0B4J293 547 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 C1QTNF9P0C862 333 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 RND2P52198 227 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 HELTA6NFD8 242 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 EFEMP2O95967 443 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 PLAUP00749 431 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 GPX1P07203 203 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 FABP4P15090 132 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 CRISP2P16562 243 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 FAM216BQ8N7L0 139 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 SSTR5P35346 364 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 WDR73Q6P4I2 378 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 NPVFQ9HCQ7 196 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 PINLYPA6NC86 204 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 LINC00869P0C866 280 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 COMPP49747 757 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 CD69Q07108 199 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 RAMP1O60894 148 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 ISG15P05161 165 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 LDLRAD3Q86YD5 345 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 SLC25A28Q96A46 364 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 TM4SF5O14894 197 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 RAB9AP51151 201 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 EMP1P54849 157 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 PDE6DO43924 150 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 IGF2P01344 180 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 NPBWR2P48146 333 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 ABHD1Q96SE0 405 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 NAT8Q9UHE5 227 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 MAS1LP35410 378 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 CRYBA2P53672 197 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 HIST1H3AP68431 136 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 PTX4Q96A99 478 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM18Q96B42 140 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 LYNX1G3V0Z9 82 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 PAGE4O60829 102 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 LYNX1P0DP58 116 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 SLC16A13Q7RTY0 426 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 WDFY1Q8IWB7 410 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 ARPC1AQ92747 370 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 DEPPQ9NTK1 212 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZNX1 250 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 AQP3Q92482 292 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PP11 408 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 MOSP00540 346 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 CX3CL1P78423 397 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 SEC11CQ9BY50 192 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 CDS2O95674 445 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 S4R3C0 116 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 SCN5AQ14524 2016 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 DEFA6Q01524 100 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 MOGAT2Q3SYC2 334 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 FBXL15Q9H469 300 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 PITX3O75364 302 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRB-204ENST00000538708 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms