RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF45Q02386 682 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ECH1Q13011 328 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TAB1Q15750 504 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF79Q15937 498 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ECSCRQ19T08 205 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 HSD17B12Q53GQ0 312 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM244Q5VVB8 128 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF774Q6NX45 483 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 DRAM2Q6UX65 266 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 Q6ZT83 130 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF584Q8IVC4 421 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 ZNF738Q8NE65 137 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OR8B12Q8NGG6 310 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OR6K3Q8NGY3 331 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SSC4DQ8WTU2 575 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ACOT12Q8WYK0 555 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SLC7A6Q92536 515 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 STARD4Q96DR4 205 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ST6GAL2Q96JF0 529 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 PRORYQ9H606 182 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 PLGRKTQ9HBL7 147 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 NOX3Q9HBY0 568 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ABCB9Q9NP78 766 aa3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 PSMB11A5LHX3 300 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 IFITM5A6NNB3 132 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 J3QRK9 145 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 M0R135 149 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 AIPO00170 330 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 HBE1P02100 147 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 SLC2A1P11166 492 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 BCL3P20749 454 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV1-2P23083 117 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 MYL9P24844 172 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 PCBD1P61457 104 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF846Q147U1 533 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 TAL2Q16559 108 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 IDNKQ5T6J7 187 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 BCL2L15Q5TBC7 163 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 DOLPP1Q86YN1 238 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 RPRMLQ8N4K4 120 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 OR2T6Q8NHC8 308 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 BORCS5Q969J3 196 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF799Q96GE5 643 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 HMG20AQ9NP66 347 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 GPR84Q9NQS5 396 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ABRACLQ9P1F3 81 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 AUP1Q9Y679 476 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 V9GYS6 101 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 DHRS7CA6NNS2 312 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 RNF212BA8MTL3 300 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 F5H5K5 113 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 H3BSH0 61 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 SOX15O60248 233 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 HPGDSO60760 199 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 APOC1P02654 83 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 IFNA6P05013 189 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 ESPL1Q14674 2120 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-214ENST00000530727 C1orf100Q5SVJ3 147 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF544Q6NX49 715 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 DPPA2Q7Z7J5 298 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-214ENST00000530727 OR5AS1Q8N127 324 aa3.29□□□□□ -1.88
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