RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 IGLC2P0DOY2 106 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 IGLC3P0DOY3 106 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ECI1P42126 302 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 TPPP2P59282 170 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2G2P60604 165 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 GTF3C1Q12789 2109 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 C12orf49Q9H741 205 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PROCRQ9UNN8 238 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ATRXP46100 2492 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 SERPINE3A8MV23 424 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 E9PLN8 166 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 GYPAP02724 150 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 WNT2P09544 360 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 AADACP22760 399 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 KISS1Q15726 138 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 WDYHV1Q96HA8 205 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF286AQ9HBT8 521 aa8.57□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 MT-ATP6P00846 226 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 BMP5P22003 454 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PAX9P55771 341 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 AGMATQ9BSE5 352 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PSG1P11464 419 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 RIPPLY3P57055 190 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PLPPR5Q32ZL2 321 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 S100A7AQ86SG5 101 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ATOH7Q8N100 152 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 OR8B12Q8NGG6 310 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 MED29Q9NX70 200 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ZGRF1Q86YA3 2104 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 CELA3AP09093 270 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 EGR1P18146 543 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 MYBPHQ13203 477 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 AQP7P3A6NL99 342 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 FAM90A27PA6NNH2 459 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 DAP3P51398 398 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 RAC3P60763 192 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 IGFL2Q6UWQ7 119 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 WFDC8Q8IUA0 241 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ST3GAL6Q9Y274 331 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PCNX1Q96RV3 2341 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PINLYPA6NC86 204 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PGPEP1LA6NFU8 196 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 VSTM5A8MXK1 200 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 DIRC3C9JPN6 131 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 BIDP55957 195 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 VAMP3Q15836 100 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 C11orf40Q8WZ69 217 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 STARD4Q96DR4 205 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PLK3Q9H4B4 646 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 MED12Q93074 2177 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV1D-33P01593 117 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV1-33P01594 117 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 CBLN1P23435 193 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 SRP14P37108 136 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 MSMO1Q15800 293 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 GPR146Q96CH1 333 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 EMC6Q9BV81 110 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 NECAP2Q9NVZ3 263 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 LAMA1P25391 3075 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.55□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 J3QW42 95 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 MMP23AO75900 390 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PRB1P04280 392 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 LHX2P50458 406 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 OR4F5Q8NH21 305 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 OR4F4Q96R69 305 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 NGBQ9NPG2 151 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 PLPP3O14495 311 aa8.54□□□□□ -1.04
TRPS1-211ENST00000520276 MDH2P40926 338 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
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