RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516914.2

RNU6-677P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 677, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-677P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-677P-201ENST00000516914 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
RNU6-677P-201ENST00000516914 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.22
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMEM235A6NFC5 223 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 C11orf86A6NJI1 115 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 FNDC10F2Z333 226 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 H3BRN7 92 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 NDUFB2O95178 105 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 MT-CO2P00403 227 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 HLA-DRAP01903 254 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 IL6P05231 212 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF728P0DKX0 622 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 MED21Q13503 144 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 EBPQ15125 230 aaKnown RBP1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMEM31Q5JXX7 168 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 CCDC121Q6ZUS5 278 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 SPATA12Q7Z6I5 190 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 LRRC34Q8IZ02 419 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM9CQ8IZT9 166 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 CLDND2Q8NHS1 167 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 MS4A6EQ96DS6 147 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 CMTM5Q96DZ9 223 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 KCTD7Q96MP8 289 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 TIPINQ9BVW5 301 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 PSMD13Q9UNM6 376 aa1.15□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 OR6C6A6NF89 314 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 IGKV1-16P04430 117 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 C8orf88P0DMB2 117 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 CD24P25063 80 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 XCL1P47992 114 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 RBM11P57052 281 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMEM33P57088 247 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 CXCR4P61073 352 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 HLA-DRB3P79483 266 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 FAM151BQ6UXP7 276 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 Q8N402 240 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 DAND5Q8N907 189 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 RPS4Y2Q8TD47 263 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 SMCR5Q8TEV8 140 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 SFRP2Q96HF1 295 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 SLC35G5Q96KT7 338 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 DHRS9Q9BPW9 319 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 HDHD2Q9H0R4 259 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 HES4Q9HCC6 221 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 ATG2BQ96BY7 2078 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 A0A087WUU8 490 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 A0A1W2PQD3 144 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 C5orf49A4QMS7 147 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 COX5BP10606 129 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 ALOX5APP20292 161 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 CTBP2P56545 445 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 TAS2R30P59541 319 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 HOXC5Q00444 222 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 SLC36A2Q495M3 483 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 AGTRAPQ6RW13 159 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 NAA40Q86UY6 237 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 GPHB5Q86YW7 130 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 BAP18Q8IXM2 172 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 SLC35F6Q8N357 371 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 PACRGLQ8N7B6 248 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 ZNF283Q8N7M2 679 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 FGF13Q92913 245 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 OR52B2Q96RD2 323 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 TMEM109Q9BVC6 243 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 NDUFB11Q9NX14 153 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 C15orf41Q9Y2V0 281 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 DSCAMO60469 2012 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 PLXNA3P51805 1871 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 A0A0A6YYH2 397 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 A6NJ64 397 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 C9JCJ5 164 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 UBE2L6O14933 153 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 TYMSP04818 313 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 IL3P08700 152 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 DDTP30046 118 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 BTN3A2P78410 334 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 PPP1R1AQ13522 171 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 PLPPR5Q32ZL2 321 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 OTUD6BQ8N6M0 293 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 MAP1LC3AQ9H492 121 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 ITGB4P16144 1822 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 SORL1Q92673 2214 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 ABCC12Q96J65 1359 aa1.11□□□□□ -2.23
RNU6-677P-201ENST00000516914 MPDZO75970 2070 aa1.11□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms