RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 SIPA1L1O43166 1804 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 REREQ9P2R6 1566 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM94Q12767 1356 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 ROS1P08922 2347 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 METTL15A6NJ78 407 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 M0R381 172 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 BHLHE40O14503 412 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 TXNDC9O14530 226 aa0.44□□□□□ -2.34
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RNU6-344P-201ENST00000516635 ATP5G1P05496 136 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPX2P18283 190 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 CXCL2P19875 107 aa0.44□□□□□ -2.34
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RNU6-344P-201ENST00000516635 AQP4P55087 323 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM258P61165 79 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 CTAG1AP78358 180 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 C4orf26Q17RF5 130 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 LGALS9BQ3B8N2 356 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC36A2Q495M3 483 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 FBXO48Q5FWF7 155 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 AADACL4Q5VUY2 407 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR10K2Q6IF99 312 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 SCGB1D4Q6XE38 83 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 NATD1Q8N6N6 113 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMCR5Q8TEV8 140 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPCDCQ96CD2 204 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 MS4A12Q9NXJ0 267 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 TAAR3PQ9P1P4 343 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 NPATQ14207 1427 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 PTPRSQ13332 1948 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 NOTCH1P46531 2555 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 AZIN1O14977 448 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 TPM1P09493 284 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 CXCL3P19876 107 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 KDELR2P33947 212 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 IFNGR2P38484 337 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 CLDN12P56749 244 aa0.43□□□□□ -2.34
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RNU6-344P-201ENST00000516635 SYCP1Q15431 976 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
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RNU6-344P-201ENST00000516635 OR1L8Q8NGR8 309 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMIM12Q96EX1 92 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR7D2Q96RA2 312 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 MED10Q9BTT4 135 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 MROQ9BYG7 248 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 UBQLN4Q9NRR5 601 aa0.43□□□□□ -2.34
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RNU6-344P-201ENST00000516635 POLEQ07864 2286 aa0.42□□□□□ -2.34
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RNU6-344P-201ENST00000516635 CD24P25063 80 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 G6PCP35575 357 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 GABRA2P47869 451 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 ETV1P50549 477 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 HADHBP55084 474 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 RBM11P57052 281 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
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RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM33P57088 247 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 GNA12Q03113 381 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 GNA13Q14344 377 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 NNATQ16517 81 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 EXOC3L4Q17RC7 722 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPERTQ8NA61 448 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 STOML3Q8TAV4 291 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 Q8WTZ3 238 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 TLCD1Q96CP7 247 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 METTL9Q9H1A3 318 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 PARVAQ9NVD7 372 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 EMC3Q9P0I2 261 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
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