RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHV3-9	P01782	118 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHE	P01854	428 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	SERPINA7	P05543	415 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	OR4A8	P0C604	315 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	CCL4	P13236	92 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB4A	P20338	218 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	IL3RA	P26951	378 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	ARR3	P36575	388 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	LHX2	P50458	406 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	CLDN18	P56856	261 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	GNB2	P62879	340 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	PAX5	Q02548	391 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	HNF4G	Q14541	408 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	RTP5	Q14D33	572 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR86	Q86TI4	376 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	OR5B12	Q96R08	314 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.16	□□□□□ -1.74
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	C22orf46	C9J442	243 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB29	O14966	203 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PAGE4	O60829	102 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	RAMP3	O60896	148 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	RHBDL1	O75783	438 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CLDN14	O95500	239 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR2H2	O95918	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MT-CO3	P00414	261 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ESD	P10768	282 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CCL2	P13500	99 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	COX5A	P20674	150 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FOLR3	P41439	243 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00310	P59036	64 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SELENOT	P62341	195 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	GNB1	P62873	340 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TFF3	Q07654	80 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FOXL1	Q12952	345 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF146	Q15072	292 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	IGFBP7	Q16270	282 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	HLA-B	Q31612	363 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF766	Q5HY98	468 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM168A	Q92567	244 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ODAM	A1E959	279 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.14	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	C12orf77	C9JDV5	145 aa		4.14	□□□□□ -1.75

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