RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC01548	A6NM66	108 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM25A	B3EWG3	89 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM25C	B3EWG5	89 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM25G	B3EWG6	89 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC22A5	O76082	557 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	HLA-DRB1	P01911	266 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKV1-16	P04430	117 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	FCGR2C	P31995	323 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	THBS3	P49746	956 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	CDK10	Q15131	360 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	IFT46	Q9NQC8	304 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF580	Q9UK33	172 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131		H7C2Y5	167 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	FBXO24	O75426	580 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	CD28	P10747	220 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	CD83	Q01151	205 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	MSMO1	Q15800	293 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	LAX1	Q8IWV1	398 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABHD1	Q96SE0	405 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC00473	A8K010	186 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131		G3V4G9	280 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131		J3QRK9	145 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	AP4M1	O00189	453 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	RRH	O14718	337 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	PPY	P01298	95 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	APOA2	P02652	100 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	CSF1	P09603	554 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	AADAC	P22760	399 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	TAS2R46	P59540	309 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM177	Q53S58	311 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	RGS5	O15539	181 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPDEF	O95238	335 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGF1	P05019	195 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	RFX2	P48378	723 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	LIN54	Q6MZP7	749 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	STPG2	Q8N412	459 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	FBXL15	Q9H469	300 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	EHF	Q9NZC4	300 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIAA1456	Q9P272	454 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	PSMB11	A5LHX3	300 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLV2-23	P01705	113 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	RRAS	P10301	218 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	RCVRN	P35243	200 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	LGALS7	P47929	136 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	PSG5	Q15238	335 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	BVES	Q8NE79	360 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR5H2	Q8NGV7	314 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	TSNAX	Q99598	290 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
SH3BP2-223	ENST00000512131	RYR3	Q15413	4870 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	PMP2	P02689	132 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	OPN1MW	P04001	364 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	CRYGB	P07316	175 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	HLA-DMA	P28067	261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	HRH1	P35367	487 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	CFHR3	Q02985	330 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SH3BP2-223	ENST00000512131	RTL8B	Q17RB0	113 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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