RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
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HDLBP-241ENST00000487169 RANP62826 216 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
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HDLBP-241ENST00000487169 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
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HDLBP-241ENST00000487169 ERVS71-1P61550 626 aa11.44□□□□□ -0.58
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HDLBP-241ENST00000487169 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-241ENST00000487169 C5orf66Q9H5L9 145 aa11.41□□□□□ -0.58
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HDLBP-241ENST00000487169 ZGRF1Q86YA3 2104 aa11.41□□□□□ -0.58
HDLBP-241ENST00000487169 PLAUP00749 431 aa11.4□□□□□ -0.58
HDLBP-241ENST00000487169 PGA5P0DJD9 388 aa11.4□□□□□ -0.58
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