RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486404.5

CHMP3-208, Transcript of charged multivesicular body protein 3, human

TSL 3

Gene CHMP3, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHMP3-208	ENST00000486404	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404		G3V318	75 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	CCL24	O00175	119 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	AIRE	O43918	545 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	IGKV1-16	P04430	117 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	PSMB8	P28062	276 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	NDP	Q00604	133 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404		Q6ZS49	121 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	RNF152	Q8N8N0	203 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	RAX2	Q96IS3	184 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	HARBI1	Q96MB7	349 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	DUX3	Q96PT4	197 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	CLCC1	Q96S66	551 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CHMP3-208	ENST00000486404		A0A1W2PN81	502 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC25A17	O43808	307 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	CA2	P00918	260 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	CTXN2	P0C2S0	81 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	CHRNA7	P36544	502 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	ARPC4	P59998	168 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	PSG5	Q15238	335 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	ARPC1A	Q92747	370 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	P2RX4	Q99571	388 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	SHOX	O15266	292 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	CNIH1	O95406	144 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	RRAS	P10301	218 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	CD40LG	P29965	261 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	GNB1	P62873	340 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	CX3CL1	P78423	397 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	DIABLO	Q9NR28	239 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	VSIG4	Q9Y279	399 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404		A0A0A6YYH2	397 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404		A6NJ64	397 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404		J3QRK9	145 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM127	O75204	238 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	PROP1	O75360	226 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	LINC00205	P59089	165 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	ACTBL2	Q562R1	376 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	CNIH2	Q6PI25	160 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	BVES	Q8NE79	360 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	OR5B12	Q96R08	314 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	GAB2	Q9UQC2	676 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	FCN1	O00602	326 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	SSX5	O60225	188 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	IGLV1-40	P01703	118 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	OR8U8	P0C7N1	319 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	LGALS7	P47929	136 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	FXYD3	Q14802	87 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	KCTD9	Q7L273	389 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	OR11H1	Q8NG94	326 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	C5orf30	Q96GV9	206 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	KLK15	Q9H2R5	256 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	GNB4	Q9HAV0	340 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	SPATA2	Q9UM82	520 aa		10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
CHMP3-208	ENST00000486404	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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