RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 SULT1A2P50226 295 aa9.47□□□□□ -0.89
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RABGEF1-207ENST00000484547 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa9.47□□□□□ -0.89
RABGEF1-207ENST00000484547 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa9.47□□□□□ -0.89
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RABGEF1-207ENST00000484547 H0YIZ8 118 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-207ENST00000484547 SSX5O60225 188 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-207ENST00000484547 ARG1P05089 322 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-207ENST00000484547 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-207ENST00000484547 RAB5CP51148 216 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP10-11P60412 298 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGEF1-207ENST00000484547 BLCAPP62952 87 aa9.44□□□□□ -0.9
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