RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482563.1

RBM39-233, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 1,737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-233	ENST00000482563		H3BSA7	217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	LST1	O00453	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	CCNK	O75909	580 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	APCS	P02743	223 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	CSN2	P05814	226 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	AKR1C3	P42330	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	CCR6	P51684	374 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	CDC42	P60953	191 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	ESRRG	P62508	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	ATP5G2	Q06055	141 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	KLHL12	Q53G59	568 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	LZIC	Q8WZA0	190 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	CCL13	Q99616	98 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563		A8MUN3	132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	TMX2-CTNND1	H3BSU7	103 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	BPY2	O14599	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	CDRT1	O95170	752 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF823	P16415	610 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	LHX2	P50458	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	FCN2	Q15485	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	SSR3	Q9UNL2	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563		A0A087WX48	190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563		A8MT66	165 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563		H7C1C5	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	CRYZL1	O95825	349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	LCN6	P62502	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	LYSMD1	Q96S90	227 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RBM39-233	ENST00000482563	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CXorf1	O96002	111 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	MAS1	P04201	325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	GPX2	P18283	190 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	BAMBI	Q13145	260 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	SP6	Q3SY56	376 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	LMX1A	Q8TE12	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	FOPNL	Q96NB1	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	PFDN5	Q99471	154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	ASB4	Q9Y574	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563		A0A0J9YWU9	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563		B8ZZF3	427 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	C8G	P07360	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CA7	P43166	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CST6	Q15828	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	LTC4S	Q16873	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	GPR82	Q96P67	336 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	SERPINI1	Q99574	410 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	RTL1	A6NKG5	1358 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	SMARCA2	P51531	1590 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	COX7A2L	O14548	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	S100A1	P23297	94 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	ATP5G3	P48201	142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	CCDC115	Q96NT0	180 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBM39-233	ENST00000482563	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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