RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 UBALD1Q8TB05 177 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 SNX22Q96L94 193 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.33□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 PPP5D1E7EU14 171 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 CLEC3BP05452 202 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 COX5AP20674 150 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 SELENOVP59797 346 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 OR10G7Q8NGN6 311 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 OR4X1Q8NH49 305 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 GALMQ96C23 342 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 SSX3Q99909 188 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 GPR87Q9BY21 358 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 HES7Q9BYE0 225 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 TTC28Q96AY4 2481 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 C17orf112F2Z3M2 114 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 PFN1P07737 140 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 FGF7P21781 194 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 IL2RGP31785 369 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 GALR1P47211 349 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 ERVK11-1P61568 191 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 GAMTQ14353 236 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 ZNF146Q15072 292 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 FBXW9Q5XUX1 488 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 OR5R1Q8NH85 324 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.32□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 NCOR1O75376 2440 aa7.32□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 KRASP01116 189 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 PPP1CBP62140 327 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 FFAR4Q5NUL3 377 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 LINC00696Q6ZRV3 163 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 OR4F5Q8NH21 305 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 OR4F4Q96R69 305 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 SLC25A22Q9H936 323 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 DVL1O14640 695 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 CDIPTO14735 213 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 PHOX2AO14813 284 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 IL18BPO95998 194 aa7.31□□□□□ -1.24
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PKP4-210ENST00000480171 SPCS3P61009 180 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 C3AR1Q16581 482 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 ACSM6Q6P461 480 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 NECAP1Q8NC96 275 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 OR1P1Q8NH06 330 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 ACY3Q96HD9 319 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 OR2D2Q9H210 308 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 PARLQ9H300 379 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 CHODLQ9H9P2 273 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 GP6Q9HCN6 339 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 OOEPA6NGQ2 149 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 RAB29O14966 203 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 LY86O95711 162 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 HRASP01112 189 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 IGKV1D-33P01593 117 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 IGKV1-33P01594 117 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 TDGF1P13385 188 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 DDTP30046 118 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 G6PCP35575 357 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 OR3A1P47881 315 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 MEOX1P50221 254 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 ZXDAP98168 799 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 SLC10A1Q14973 349 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 REC114Q7Z4M0 266 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-210ENST00000480171 WDR86Q86TI4 376 aa7.31□□□□□ -1.24
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