RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 CASTOR1Q8WTX7 329 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 NINJ1Q92982 152 aa14.84□□□□□ -0.03
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 FAM157AC9JC47 383 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 F2RL2O00254 374 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 ARF6P62330 175 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 PIMREGQ9BSJ6 248 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 NOTCH2Q04721 2471 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM128Q5BJH2 165 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 BTNL3Q6UXE8 466 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 VWC2LB2RUY7 222 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 HTD2P86397 168 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 DEFB113Q30KQ7 82 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 OR2D2Q9H210 308 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 RAB18Q9NP72 206 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.82□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 AGMATQ9BSE5 352 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 RSRP1Q9BUV0 290 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 SEC11CQ9BY50 192 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 FAM25EA8MYX2 175 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 SNAPINO95295 136 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.81□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 GPR31O00270 319 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 ADCYAP1P18509 176 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 RNF126Q9BV68 326 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 SIRT7Q9NRC8 400 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 CYTL1Q9NRR1 136 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 C5orf51A6NDU8 294 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 PROP1O75360 226 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 PAX1P15863 534 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 DRAM1Q8N682 238 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 DCUN1D4Q92564 292 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 MLXQ9UH92 298 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 JPT1Q9UK76 154 aa14.8□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 FAM157CP0CG43 387 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 IGHV1-8P0DP01 117 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 KCTD9Q7L273 389 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 Q8N7P7 452 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 LY6G5BQ8NDX9 201 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 OR51H1Q8NH63 302 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 AQP10Q96PS8 301 aa14.79□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 YPEL1O60688 119 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 UCP3P55916 312 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 YPEL2Q96QA6 119 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 F8W036 122 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 SFT2D2O95562 160 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 BLOC1S1P78537 153 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 GUCA2BQ16661 112 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 OR2B11Q5JQS5 317 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 TP53RKQ96S44 253 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1W2PRD5 423 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1W2PRF3 423 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 A0A1W2PRM7 423 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF98A6NK75 572 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 OR5AC1P0C628 307 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 PET100P0DJ07 73 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 COX7A1P24310 79 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGDIBP52566 201 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 KLRD1Q13241 179 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.77□□□□□ -0.04
ATG4B-217ENST00000475693 Q3ZCU0 254 aa14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.4 ms