RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470953.1

VARS-222, Transcript of valyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene VARS, Length 392 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VARS-222	ENST00000470953	TALDO1	P37837	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	HLA-DRB3	P79483	266 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	UNC119	Q13432	240 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	ARFRP1	Q13795	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	COTL1	Q14019	142 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	GNMT	Q14749	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	PLGLA	Q15195	96 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	MMD	Q15546	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	NEDD8	Q15843	81 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	C22orf42	Q6IC83	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SSR3	Q9UNL2	185 aa		4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	LY6L	H3BQJ8	138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953		H7C2Y5	167 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953		J3QL48	77 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SLC31A2	O15432	143 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	FGF16	O43320	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SSX5	O60225	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SC5D	O75845	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	MOS	P00540	346 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	AMY1A	P04745	511 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	AMY2A	P04746	511 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	CGB3	P0DN86	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	CGB7	P0DN87	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SPN	P16150	400 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	VDAC1	P21796	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	ZBTB25	P24278	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	OR10A3	P58181	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RAB4B	P61018	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	HMGN3	Q15651	99 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SSX1	Q16384	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	UTF1	Q5T230	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	ZNF773	Q6PK81	442 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	S1PR3	Q99500	378 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	AK3	Q9UIJ7	227 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	IFITM5	A6NNB3	132 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	FAM25A	B3EWG3	89 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	FAM25C	B3EWG5	89 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	FAM25G	B3EWG6	89 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	AP4M1	O00189	453 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	RAB29	O14966	203 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SOCS1	O15524	211 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	LANCL1	O43813	399 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	YPEL1	O60688	119 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SCGN	O76038	276 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	APOA2	P02652	100 aa		4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
VARS-222	ENST00000470953	GAL	P22466	123 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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