RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 CEACAM21Q3KPI0 293 aa11.41□□□□□ -0.58
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SH3BP1-206ENST00000469947 WDYHV1Q96HA8 205 aa11.41□□□□□ -0.58
SH3BP1-206ENST00000469947 STRADBQ9C0K7 418 aa11.41□□□□□ -0.58
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SH3BP1-206ENST00000469947 F2Z2F3 143 aa11.4□□□□□ -0.58
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SH3BP1-206ENST00000469947 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 TGFBR3Q03167 851 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 DTD1Q8TEA8 209 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 IMMP1LQ96LU5 166 aa11.37□□□□□ -0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa11.36□□□□□ -0.59
SH3BP1-206ENST00000469947 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.36□□□□□ -0.59
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SH3BP1-206ENST00000469947 RANP62826 216 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
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