RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 DTD1Q8TEA8 209 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ADTRPQ96IZ2 230 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 YPEL4Q96NS1 127 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OR4C12Q96R67 309 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OR2D2Q9H210 308 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OR51B6Q9H340 312 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 NAT8Q9UHE5 227 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 TINAGQ9UJW2 476 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 AKAP13Q12802 2813 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 IGF2RP11717 2491 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PPH5 198 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 SRRM5B3KS81 715 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 F2RL2O00254 374 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MLNRO43193 412 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 PSPNO60542 156 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ZNF737O75373 536 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 VENTXO95231 258 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CGAP01215 116 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CELA3BP08861 270 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CECR9P0C854 216 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 GLRXP35754 106 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MPV17P39210 176 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 SPCS3P61009 180 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ERVK-16P61578 105 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 PRR18Q8N4B5 295 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OR1L1Q8NH94 360 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CORO2AQ92828 525 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 RAB1CQ92928 201 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 LHX4Q969G2 390 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 S100PBPQ96BU1 408 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ABHD17AQ96GS6 310 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 DIRC2Q96SL1 478 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 FAM234AQ9H0X4 552 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CHODLQ9H9P2 273 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 GNG13Q9P2W3 67 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ODAMA1E959 279 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 FNDC10F2Z333 226 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 WISP2O76076 250 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 KRASP01116 189 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CRYAAP02489 173 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 FAM87AP0C7U9 286 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 IAPPP10997 89 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 HOXA5P20719 270 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 S100PP25815 95 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 TIMP3P35625 211 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 GATA4P43694 442 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 GPR12P47775 334 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OR2B8PP59922 312 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 RAB11AP62491 216 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 RUNX1Q01196 453 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 COL10A1Q03692 680 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 AESQ08117 197 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 C1orf87Q8N0U7 546 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 C9orf106Q8NAJ2 232 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 OR10A7Q8NGE5 316 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 NANPQ8TBE9 248 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 STARD4Q96DR4 205 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 COQ2Q96H96 371 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC13O75165 2243 aa7.11□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 A0A1W2PPE2 198 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 CEBPZOSA8MTT3 80 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ZNF727A8MUV8 499 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 VSTM5A8MXK1 200 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 H0YL77 283 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 H3BP45 60 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 C15orf65H3BRN8 121 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 PPP1R2P9O14990 202 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 PDE6DO43924 150 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 TNFSF13O75888 250 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 ARG1P05089 322 aa7.1□□□□□ -1.27
ACTB-208ENST00000464611 NQO2P16083 231 aa7.1□□□□□ -1.27
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