RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF383Q8NA42 475 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 FCGR1BQ92637 280 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 B9D2Q9BPU9 175 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 GNB4Q9HAV0 340 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 SCOCQ9UIL1 159 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 A0A1W2PN81 502 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 NOTOA8MTQ0 251 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 M0R1X1 148 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 MFNGO00587 321 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 ATP6V1G2O95670 118 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 IGKV1-16P04430 117 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 FCGR3AP08637 254 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 CTXN2P0C2S0 81 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 RRASP10301 218 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 GNB3P16520 340 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 DTYMKP23919 212 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 CHRNA7P36544 502 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 ECI1P42126 302 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 LINC00205P59089 165 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 PITPNAQ00169 270 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 CD69Q07108 199 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 CBX3Q13185 183 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 ARFRP1Q13795 201 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 ECSCRQ19T08 205 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 MOGAT2Q3SYC2 334 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 CDNFQ49AH0 187 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 ACTBL2Q562R1 376 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 IGSF11Q5DX21 431 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF429Q86V71 674 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 LFNGQ8NES3 379 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 RHOVQ96L33 236 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM68Q96MH6 324 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 CLCC1Q96S66 551 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 ATG5Q9H1Y0 275 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 SLA2Q9H6Q3 261 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 TPSG1Q9NRR2 321 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 SLC35D1Q9NTN3 355 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 SDHAF2Q9NX18 166 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 SSR3Q9UNL2 185 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 FBXO7Q9Y3I1 522 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-210ENST00000463041 TENM3Q9P273 2699 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 A0A075B6Q4 140 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 A0A0G2JLM5 398 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 LINC01619G3V211 115 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 H3BUA1 57 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 OVOL1O14753 267 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A17O43808 307 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 SOX15O60248 233 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 SCGNO76038 276 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 SLC22A5O76082 557 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 CNIH1O95406 144 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 BRI3O95415 125 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 CA2P00918 260 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 CRYGBP07316 175 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 PSMB9P28065 219 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 GNB1P62873 340 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 NDPQ00604 133 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 FXYD3Q14802 87 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 RTL8BQ17RB0 113 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM177Q53S58 311 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 HACD4Q5VWC8 232 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 TEX45Q8NA69 505 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 DCUN1D4Q92564 292 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 OR5B12Q96R08 314 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 GINS4Q9BRT9 223 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 OR2D2Q9H210 308 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 DCSTAMPQ9H295 470 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 STUB1Q9UNE7 303 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 A3GALT2U3KPV4 340 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 A0A0B4J203 849 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 SHOXO15266 292 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 IGLV2-23P01705 113 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 SCAND1P57086 179 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 CNIH2Q6PI25 160 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF773Q6PK81 442 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 BVESQ8NE79 360 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 OR5T1Q8NG75 326 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 ARPC1AQ92747 370 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
PTPRF-210ENST00000463041 MS4A10Q96PG2 267 aa5.63□□□□□ -1.51
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