RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 CD1BP29016 333 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 BRS3P32247 399 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 BTCP35070 178 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ARHGDIBP52566 201 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00205P59089 165 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 HILS1P60008 231 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 BAMBIQ13145 260 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ZBTB34Q8NCN2 500 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 BVESQ8NE79 360 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 DDB2Q92466 427 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 GPHA2Q96T91 129 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.22□□□□□ -1.09
GARNL3-211ENST00000460176 A6NDX4 124 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 NAP1L6A6NFF2 107 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 LINC00473A8K010 186 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 H0YJW9 148 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 GPR31O00270 319 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 TNFSF12O43508 249 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 VENTXO95231 258 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 PGAM2P15259 253 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 ECI1P42126 302 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 THBS3P49746 956 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 EBI3Q14213 229 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 LPCAT3Q6P1A2 487 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM86BQ8N661 226 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 OR5R1Q8NH85 324 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 SSMEM1Q8WWF3 244 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 BORCS5Q969J3 196 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 DPAGT1Q9H3H5 408 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 TCF19Q9Y242 345 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 POMT1Q9Y6A1 747 aa8.21□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 A0A0A6YYJ9 748 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 CENPXA8MT69 81 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 CLDN34H7C241 214 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 LYRM1O43325 122 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV1D-33P01593 117 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV1-33P01594 117 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 PI3P19957 117 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 MC5RP33032 325 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 CCR6P51684 374 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 ASAH1Q13510 395 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 LY6EQ16553 131 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 PHLDA2Q53GA4 152 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF66Q6ZN08 573 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 KCTD9Q7L273 389 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 Q8N6K4 173 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 DUX5Q96PT3 197 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 CHIAQ9BZP6 476 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 TNFRSF19Q9NS68 423 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 VPREB3Q9UKI3 123 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 GPR132Q9UNW8 380 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 VSIG4Q9Y279 399 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 CUBNO60494 3623 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 ZFHX3Q15911 3703 aa8.2□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 BTBD17A6NE02 478 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 TCF21O43680 179 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 NDUFB6O95139 128 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 APOA2P02652 100 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 RLN1P04808 185 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 FAM106CPP0CH98 169 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 RND3P61587 244 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 UBA52P62987 128 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM219Q86XT9 240 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 PDPNQ86YL7 162 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa8.19□□□□□ -1.1
GARNL3-211ENST00000460176 RITA1Q96K30 269 aa8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms