RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 WDR31Q8NA23 367 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 PIGCQ92535 297 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 CLEC7AQ9BXN2 247 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 SCN4AP35499 1836 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 DENND4AQ7Z401 1863 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PPI3 338 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF708P17019 499 aa4.81□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 C1QL3Q5VWW1 255 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 GLB1LQ6UWU2 654 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 LIPT2A6NK58 231 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 ACRV1P26436 265 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 COL8A1P27658 744 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA46Q5T0L3 261 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 KLHDC7BQ96G42 594 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF714Q96N38 554 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 COMMD5Q9GZQ3 224 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 A0A0U1RRA0 63 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 ZNF117Q03924 483 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 A8MWL6 223 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 J3QLI3 93 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 KLK8O60259 260 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 IRF1P10914 325 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 Q0VG73 95 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 MS4A13Q5J8X5 152 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 STPG3Q8N7X2 389 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 PSME4Q14997 1843 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PRD5 423 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 K7N7A8 449 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 FCGR3BO75015 233 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 NAPSAO96009 420 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 SP9P0CG40 484 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 ADRA1AP35348 466 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 LIM2P55344 173 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 EDDM3BP56851 147 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 AMN1Q8IY45 258 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 PLA2G12BQ9BX93 195 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 PRNDQ9UKY0 176 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 LOXL2Q9Y4K0 774 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 CHD1O14646 1710 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 KNDC1Q76NI1 1749 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 CACNA1DQ01668 2161 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRC-209ENST00000442510 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PQF6 199 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 NPIPB13A6NJU9 1138 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 NPIPB4C9JG80 1138 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 HOXB2P14652 356 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF137PP52743 207 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 VGLL4Q14135 290 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRC-209ENST00000442510 WFDC2Q14508 124 aa4.79□□□□□ -1.64
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