RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 DTD1Q8TEA8 209 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 PKDREJQ9NTG1 2253 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 IGLV2-14P01704 120 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 OR4A8P0C604 315 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 OR8G1Q15617 311 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF664Q8N3J9 261 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 LEAP2Q969E1 77 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 NEURL1O76050 574 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 C1QTNF9P0C862 333 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 IMMP2LQ96T52 175 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 GZMBP10144 247 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 CLDN18P56856 261 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC35B1P78383 322 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC25A40Q8TBP6 338 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 GALMQ96C23 342 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 LURAP1Q96LR2 239 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FOXJ2Q9P0K8 574 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 TECTAO75443 2155 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 LAMTOR5O43504 91 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 RTL8AQ9BWD3 113 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 IL17BQ9UHF5 180 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 COLCA1Q6ZS62 124 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 OR2T10Q8NGZ9 312 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 METRNQ9UJH8 293 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 PCNX1Q96RV3 2341 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 B4DEV8 164 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 SH2D1BO14796 132 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 DNPH1O43598 174 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FCGR3BO75015 233 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 CEACAM1P13688 526 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 PRR31Q5SQ13 230 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 ASPHD1Q5U4P2 390 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 VHLLQ6RSH7 139 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 ACTL6BO94805 426 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 ARR3P36575 388 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 RPL29P47914 159 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM183AQ8IXX5 376 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 OR8G5Q8NG78 346 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM173AQ9BQD7 235 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 GNG12Q9UBI6 72 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 C12orf77C9JDV5 145 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 J3QT63 122 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 KBTBD11O94819 623 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 HAND1O96004 215 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM256Q8N2U0 113 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 DUSP13Q9UII6 198 aa15.36■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 HBZP02008 142 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 COX5AP20674 150 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 MEOX1P50221 254 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 CASP6P55212 293 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF318Q5VUA4 2279 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 PPP1CBP62140 327 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa15.35■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 SERF2P84101 59 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 MSMO1Q15800 293 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 REC114Q7Z4M0 266 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 OR5B21A6NL26 309 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 IL18BPO95998 194 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 TBC1D28Q2M2D7 210 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 KALRNO60229 2985 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM90A10PA6NDY2 464 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM90A18PA6NE21 464 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM90A16PA6NEW6 464 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM90A7PA6NKC0 464 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM90A22PA8MWA6 464 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM90A12PA8MX19 464 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM90A15PP0C7V4 464 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM90A13PP0C7W8 464 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM90A14PP0C7W9 464 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM90A24PP0C7X0 464 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 MAS1LP35410 378 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF114Q8NC26 417 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 SRD5A3Q9H8P0 318 aa15.34■□□□□ 0.05
PTPRJ-202ENST00000440289 EREGO14944 169 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-202ENST00000440289 MPV17P39210 176 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-202ENST00000440289 NUBP1P53384 320 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-202ENST00000440289 SSPNQ14714 243 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-202ENST00000440289 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-202ENST00000440289 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-202ENST00000440289 Q6P435 159 aa15.33■□□□□ 0.04
PTPRJ-202ENST00000440289 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms