RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436228.6

SPDYE2B-201, Transcript of speedy/RINGO cell cycle regulator family member E2B, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPDYE2B, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE2B-201ENST00000436228 IGKV1-13P0DP09 117 aa13.3□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 RTL8BQ17RB0 113 aa13.3□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 PYDC2Q56P42 97 aa13.3□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 C9orf152Q5JTZ5 239 aa13.3□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 DHRS11Q6UWP2 260 aa13.3□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 PDPNQ86YL7 162 aa13.3□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 TMEM229BQ8NBD8 167 aa13.3□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 OR5AN1Q8NGI8 311 aa13.3□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 RASL11BQ9BPW5 248 aa13.3□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 SLC35D1Q9NTN3 355 aa13.3□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 KIAA1456Q9P272 454 aa13.3□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 RRASP10301 218 aa13.29□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 MMDQ15546 238 aa13.29□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 ABCA11PQ4W5N1 156 aa13.29□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 VAX1Q5SQQ9 334 aa13.29□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 C11orf88Q6PI97 169 aa13.29□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 Q8N6K4 173 aa13.29□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZBTB34Q8NCN2 500 aa13.29□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa13.29□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 LINC01006Q8NI28 216 aa13.29□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa13.29□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 RNF114Q9Y508 228 aa13.29□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 M0QYG6 137 aa13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 PROP1O75360 226 aa13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 RAB3DO95716 219 aa13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 CD3DP04234 171 aa13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 S100GP29377 79 aa13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 RPS16P62249 146 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 BLCAPP62952 87 aa13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 MSMO1Q15800 293 aa13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 FBLN7Q53RD9 439 aa13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 CCDC190Q86UF4 302 aa13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF383Q8NA42 475 aa13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 MOB3AQ96BX8 217 aa13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 RNF5Q99942 180 aa13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 SOSTQ9BQB4 213 aa13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF702PQ9H963 129 aa13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 CCL28Q9NRJ3 127 aa13.28□□□□□ -0.28
SPDYE2B-201ENST00000436228 NBR2O15453 112 aa13.27□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 DUTP33316 252 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 MEF2DQ14814 521 aa13.27□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 PLGLAQ15195 96 aa13.27□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 STEAP1BQ6NZ63 245 aa13.27□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 LPCAT3Q6P1A2 487 aa13.27□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 KCTD9Q7L273 389 aa13.27□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 ARRDC1Q8N5I2 433 aa13.27□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 C5orf56Q8N8D9 126 aa13.27□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 DISC1C4P0D8 188 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 AKAIN1P0CW23 69 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 ETV6P41212 452 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 LINC00205P59089 165 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 CATR1Q13166 79 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF66Q6ZN08 573 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 CMTM1Q8IZ96 169 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 Q8N2B8 174 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 Q8N402 240 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 BVESQ8NE79 360 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 C5orf30Q96GV9 206 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 SIGLEC9Q9Y336 463 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 V9GYH0 126 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 FBN3Q75N90 2809 aa13.26□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 ANK2Q01484 3957 aa13.25□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 SHOXO15266 292 aa13.25□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 CD74P04233 296 aa13.25□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 AMY2AP04746 511 aa13.25□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 KIR2DS2P43631 304 aa13.25□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 INPP1P49441 399 aa13.25□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 F2RL1P55085 397 aa13.25□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 AP3S2P59780 193 aa13.25□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 CNPY1Q3B7I2 92 aa13.25□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 PRR31Q5SQ13 230 aa13.25□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 Q8N9W7 124 aa13.25□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 LINC00473A8K010 186 aa13.24□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 GPR31O00270 319 aa13.24□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 KCNAB3O43448 404 aa13.24□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 TNFSF12O43508 249 aa13.24□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 FCGR3BO75015 233 aa13.24□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 CRYZL1O95825 349 aa13.24□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 AMY1AP04745 511 aa13.24□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 PGAM2P15259 253 aa13.24□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 FAUP35544 74 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 LGALS7P47929 136 aa13.24□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa13.24□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa13.24□□□□□ -0.29
SPDYE2B-201ENST00000436228 SLC35E3Q7Z769 313 aa13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms