RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418663.5

AC004980.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC004980.1, Length 2,667 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004980.1-201ENST00000418663 C11orf53Q8IXP5 236 aa18.28■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 HSPB7Q9UBY9 170 aa18.28■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 LRRC30A6NM36 301 aa18.28■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 IQCF6A8MYZ5 107 aa18.28■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 PPP1R2P9O14990 202 aa18.28■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 IFNA1P01562 189 aa18.28■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 PIP4P1Q86T03 277 aa18.28■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 NINJ1Q92982 152 aa18.28■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 AKAP13Q12802 2813 aa18.28■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 ST8SIA5O15466 376 aa18.27■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 FABP6P51161 128 aa18.27■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 SNX22Q96L94 193 aa18.27■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 TGFBR3Q03167 851 aa18.27■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 FFAR4Q5NUL3 377 aa18.27■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 C16orf82Q7Z2V1 217 aa18.27■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 HIST3H2BBQ8N257 126 aa18.27■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 OR10G9Q8NGN4 311 aa18.27■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 OR10G7Q8NGN6 311 aa18.27■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 DTD1Q8TEA8 209 aa18.27■□□□□ 0.52
AC004980.1-201ENST00000418663 FABP4P15090 132 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 RTP5Q14D33 572 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 MSMO1Q15800 293 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 Q3ZCU0 254 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 P2RX4Q99571 388 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 LINC00473A8K010 186 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 IGHV3-13P01766 116 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 IGHV3-7P01780 117 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 RND2P52198 227 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 GABRA6Q16445 453 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 NCR3LG1Q68D85 454 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 ALKBH2Q6NS38 261 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 OR5T1Q8NG75 326 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 OR13A1Q8NGR1 328 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 PSG11Q9UQ72 335 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 ZNF292O60281 2723 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 EDDM3AQ14507 147 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 OR4F5Q8NH21 305 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 OR4F4Q96R69 305 aa18.26■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 ATMQ13315 3056 aa18.25■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 OOEPA6NGQ2 149 aa18.25■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 SEC14L6B5MCN3 397 aa18.25■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 FAM90A26D6RGX4 464 aa18.25■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 COL10A1Q03692 680 aa18.25■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 VWA1Q6PCB0 445 aa18.25■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 FAM234AQ9H0X4 552 aa18.25■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 ASCL3Q9NQ33 180 aa18.25■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 GAB2Q9UQC2 676 aa18.25■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa18.25■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 TMEM147Q9BVK8 224 aa18.25■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 HES4Q9HCC6 221 aa18.25■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 P0C879 139 aa18.24■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 CATR1Q13166 79 aa18.24■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 ACP7Q6ZNF0 438 aa18.24■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 OR10P1Q8NGE3 313 aa18.24■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 NAT8Q9UHE5 227 aa18.24■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 PMS2P5A8MQ11 134 aa18.24■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 TMEM241Q24JQ0 296 aa18.24■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 ELOVL1Q9BW60 279 aa18.24■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 PSMB3P49720 205 aa18.23■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 WDR82Q6UXN9 313 aa18.23■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 SSX9Q7RTT3 188 aa18.23■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 TMEM210A6NLX4 147 aa18.23■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 SLC35E4Q6ICL7 350 aa18.23■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 OR13D1Q8NGV5 346 aa18.23■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 PFDN5Q99471 154 aa18.23■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 RPL23P62829 140 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 FOXF2Q12947 444 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 RAB24Q969Q5 203 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 NPCDR1Q9BY65 106 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 PARLQ9H300 379 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 TMEM242Q9NWH2 141 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 LAMP3Q9UQV4 416 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 PAGE4O60829 102 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 OPN1MWP04001 364 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 OPN1MW2P0DN77 364 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 OPN1MW3P0DN78 364 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 BSXQ3C1V8 233 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 GCSAMLQ5JQS6 135 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 FAM214BQ7L5A3 538 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 CLCF1Q9UBD9 225 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 TIMM9Q9Y5J7 89 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 DMRT1Q9Y5R6 373 aa18.22■□□□□ 0.51
AC004980.1-201ENST00000418663 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms