RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407117.6

ANKRD54-203, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 789 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-203ENST00000407117 FCGR1BQ92637 280 aa21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 GSTT2P0CG29 244 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 GSTT2BP0CG30 244 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 INSL3P51460 131 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 GNB1P62873 340 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 CD69Q07108 199 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 IGSF11Q5DX21 431 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 PPP1R27Q86WC6 154 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 SPARTQ8N0X7 666 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 SCOCQ9UIL1 159 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 A3GALT2U3KPV4 340 aa21.55■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 A0A075B6Q4 140 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 OR8U9P0C7N5 309 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 ACTBL2Q562R1 376 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 VAX1Q5SQQ9 334 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 ASPHD1Q5U4P2 390 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 Q6ZS49 121 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 NR2C2APQ86WQ0 139 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 OR5B12Q96R08 314 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 OR2D2Q9H210 308 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC35D1Q9NTN3 355 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 CA2P00918 260 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 PSMB9P28065 219 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 CD40LGP29965 261 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 TALDO1P37837 337 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 LINC00205P59089 165 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 ARFRP1Q13795 201 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF260Q3ZCT1 412 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 CLCC1Q96S66 551 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 SDHAF2Q9NX18 166 aa21.53■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 A0A0B4J203 849 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 NOTOA8MTQ0 251 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 LGALS7P47929 136 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 ARPC1AQ92747 370 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 ATG5Q9H1Y0 275 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 STUB1Q9UNE7 303 aa21.52■■□□□ 1.04
ANKRD54-203ENST00000407117 SLC25A17O43808 307 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 CBX3Q13185 183 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 TPRA1Q86W33 373 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 LFNGQ8NES3 379 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 MAFIPQ8WZ33 124 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 GINS4Q9BRT9 223 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 SLA2Q9H6Q3 261 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 DTYMKP23919 212 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 ECI1P42126 302 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 DNAH9Q9NYC9 4486 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 COL7A1Q02388 2944 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 LINC01619G3V211 115 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 SCGNO76038 276 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 FXYD3Q14802 87 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 TPSG1Q9NRR2 321 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 SSR3Q9UNL2 185 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 OVOL1O14753 267 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 RRASP10301 218 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 RTL8BQ17RB0 113 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 C11orf87Q6NUJ2 197 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF429Q86V71 674 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 CASTOR1Q8WTX7 329 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 DCUN1D4Q92564 292 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 ADTRPQ96IZ2 230 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 HARBI1Q96MB7 349 aa21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 SMIM30A4D0T7 59 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 IGLV2-23P01705 113 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 CDNFQ49AH0 187 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM177Q53S58 311 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 GRPEL2Q8TAA5 225 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 PRR25Q96S07 402 aa21.47■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 H3BUA1 57 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 TPPP2P59282 170 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 HACD4Q5VWC8 232 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 C5orf30Q96GV9 206 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 TMEM68Q96MH6 324 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 DCSTAMPQ9H295 470 aa21.46■■□□□ 1.03
ANKRD54-203ENST00000407117 SHOXO15266 292 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54-203ENST00000407117 CNIH1O95406 144 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54-203ENST00000407117 CRYGBP07316 175 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54-203ENST00000407117 CTXN2P0C2S0 81 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54-203ENST00000407117 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54-203ENST00000407117 PITPNAQ00169 270 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54-203ENST00000407117 ZNF773Q6PK81 442 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54-203ENST00000407117 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54-203ENST00000407117 RHOVQ96L33 236 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54-203ENST00000407117 MS4A10Q96PG2 267 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD54-203ENST00000407117 DAPK2Q9UIK4 370 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72 ms