RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 GTF2BQ00403 316 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 CENPWQ5EE01 88 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 NATD1Q8N6N6 113 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR2D3Q8NGH3 330 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR2AE1Q8NHA4 323 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR5K1Q8NHB7 308 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 SYT4Q9H2B2 425 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMBIM4Q9HC24 238 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 MS4A12Q9NXJ0 267 aa-0.22□□□□□ -2.44
RNU6-601P-201ENST00000384540 TNCP24821 2201 aa-0.22□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 GREB1Q4ZG55 1949 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGSF10Q6WRI0 2623 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 E9PCH4 1651 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM212A6NML5 194 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 M0QYV0 167 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 NCR3O14931 201 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATP8B1O43520 1251 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 CRATP43155 626 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR1E2P47887 323 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 ETV1P50549 477 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 TSPAN5P62079 268 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 HIKESHIQ53FT3 197 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 CAVIN4Q5BKX8 364 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 ACTL10Q5JWF8 245 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 DAND5Q8N907 189 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR13C8Q8NGS7 320 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 ASB13Q8WXK3 278 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 AQP3Q92482 292 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 IMMP2LQ96T52 175 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 NMNAT3Q96T66 252 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTTY13Q9BZ97 58 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR51E2Q9H255 320 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 LINC00527Q9UJ94 153 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZFP30Q9Y2G7 519 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 GMEB1Q9Y692 573 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 SIPA1L1O43166 1804 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa-0.23□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 NCOR2Q9Y618 2525 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRAV7A0A075B6U4 112 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 H3BT86 120 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 MBP02144 154 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 RBM11P57052 281 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 NDUFA5Q16718 116 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAHD1Q6P587 224 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 PID1Q7Z2X4 250 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPATA12Q7Z6I5 190 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM75Q8N9X5 138 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 ACBD4Q8NC06 268 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR51H1Q8NH63 302 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF675Q8TD23 568 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 IFT81Q8WYA0 676 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 TESCQ96BS2 214 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 TAMM41Q96BW9 452 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 NABP2Q9BQ15 211 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM222Q9H0R3 208 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 RGCCQ9H4X1 137 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 KLK9Q9UKQ9 250 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 SNX10Q9Y5X0 201 aa-0.24□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 ALPK3Q96L96 1907 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 A0A0J9YW62 118 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR51F1A6NGY5 319 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 EFCAB9A8MZ26 197 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 C21orf140B9A014 251 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLDN25C9JDP6 229 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 hCG_2039718K7EN88 272 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 FABP7O15540 132 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR2T1O43869 369 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 IGLV3-27P01718 113 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 PEX19P40855 299 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 CA7P43166 264 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 SPINK7P58062 85 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 MIAQ16674 131 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 PLCZ1Q86YW0 608 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 BAP18Q8IXM2 172 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR8B3Q8NGG8 313 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM45AQ8TCE6 357 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 UBQLN4Q9NRR5 601 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa-0.25□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 CHD5Q8TDI0 1954 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 DENND4CQ5VZ89 1909 aa-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP-0.26□□□□□ -2.45
RNU6-601P-201ENST00000384540 STRCQ7RTU9 1775 aa-0.26□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.4 ms