RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 PNKDQ8N490 385 aa9.14□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 ZNF721Q8TF20 911 aa9.14□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9.14□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 TMEM210A6NLX4 147 aa9.14□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 OR10J1P30954 320 aa9.14□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 CD300CQ08708 224 aa9.14□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 WNT2BQ93097 391 aa9.14□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 TMEM174Q8WUU8 243 aa9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 H3BQ15 152 aa9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 LILRA6Q6PI73 481 aa9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 ABHD12Q8N2K0 398 aa9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 SLC17A5Q9NRA2 495 aa9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 NEU3Q9UQ49 428 aa9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 A0A0J9YW62 118 aa9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PP11 408 aa9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 IGKV1D-16P01601 117 aa9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 RND2P52198 227 aa9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 ZNF343Q6P1L6 599 aa9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 KLK13Q9UKR3 277 aa9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PS18 150 aa9.13□□□□□ -0.95
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CLN8-201ENST00000331222 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.13□□□□□ -0.95
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CLN8-201ENST00000331222 PDLIM4P50479 330 aa9.13□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 J3QT63 122 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 CD99P14209 185 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 CDC20Q12834 499 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 PLPPR5Q32ZL2 321 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 MYLKQ15746 1914 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 A6NDN8 102 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 SIGIRRQ6IA17 410 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 ZNF645Q8N7E2 425 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 C18orf15Q96N68 181 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 NACAE9PAV3 2078 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 PRR32B1ATL7 298 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 PCMT1P22061 227 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 LHX2P50458 406 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 STARD6P59095 220 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 CARFQ8N187 725 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 DUX3Q96PT4 197 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 TMEM160Q9NX00 188 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 A0A0U1RQV5 110 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 TSPAN13O95857 204 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 ALG14Q96F25 216 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 MOSP00540 346 aa9.12□□□□□ -0.95
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CLN8-201ENST00000331222 KIAA0040Q15053 153 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 MIC13Q5XKP0 118 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 LSMEM1Q8N8F7 131 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 OPN4Q9UHM6 478 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 LEUTXA8MZ59 168 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 TRGV3P03979 118 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 PGA4P0DJD7 388 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 PGA5P0DJD9 388 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 MESP2Q0VG99 397 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 SPATA45Q537H7 98 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 LHFPL5Q8TAF8 219 aa9.12□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 M0R143 59 aa9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 ARL14EPLP0DKL9 152 aa9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 C10orf111Q8N326 155 aa9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 FDCSPQ8NFU4 85 aa9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 RNF115Q9Y4L5 304 aa9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 GDF9O60383 454 aa9.11□□□□□ -0.95
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CLN8-201ENST00000331222 MRGPRGQ86SM5 289 aa9.11□□□□□ -0.95
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CLN8-201ENST00000331222 RBM11P57052 281 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 C3orf36Q3SXR2 165 aa9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 TMEM177Q53S58 311 aa9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa9.11□□□□□ -0.95
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CLN8-201ENST00000331222 CD69Q07108 199 aa9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 MSRB3Q8IXL7 192 aa9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 FXYD1O00168 92 aa9.11□□□□□ -0.95
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CLN8-201ENST00000331222 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 OR4C45A6NMZ5 311 aa9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 SP9P0CG40 484 aa9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 LY6DQ14210 128 aa9.11□□□□□ -0.95
CLN8-201ENST00000331222 FAM214BQ7L5A3 538 aa9.11□□□□□ -0.95
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