RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309576.10

PPARG-202, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene PPARG, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-202ENST00000309576 NABP2Q9BQ15 211 aa16.08■□□□□ 0.17
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PPARG-202ENST00000309576 DHFRP00374 187 aa16.08■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 SGPP2Q8IWX5 399 aa16.08■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 RPEQ96AT9 228 aa16.08■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 MALSU1Q96EH3 234 aa16.08■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 SEC22CQ9BRL7 303 aa16.08■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 HILPDAQ9Y5L2 63 aa16.08■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
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PPARG-202ENST00000309576 A0A1W2PPI3 338 aa16.07■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
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PPARG-202ENST00000309576 C4orf46Q504U0 113 aa16.07■□□□□ 0.16
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PPARG-202ENST00000309576 C7orf66A4D0T2 115 aa16.06■□□□□ 0.16
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PPARG-202ENST00000309576 SFT2D2O95562 160 aa16.05■□□□□ 0.16
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PPARG-202ENST00000309576 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 ZNF585BQ52M93 769 aa16.05■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa16.05■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 PRR13Q9NZ81 148 aa16.05■□□□□ 0.16
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PPARG-202ENST00000309576 RNF212BA8MTL3 300 aa16.05■□□□□ 0.16
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PPARG-202ENST00000309576 TXNL1O43396 289 aa16.05■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 RAMP3O60896 148 aa16.05■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 LY6G6DO95868 133 aa16.05■□□□□ 0.16
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PPARG-202ENST00000309576 TMEM187Q14656 261 aa16.05■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 ADTRPQ96IZ2 230 aa16.05■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 TMEM222Q9H0R3 208 aa16.05■□□□□ 0.16
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PPARG-202ENST00000309576 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 CFHR4Q92496 578 aa16.04■□□□□ 0.16
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PPARG-202ENST00000309576 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa16.04■□□□□ 0.16
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PPARG-202ENST00000309576 SPAG16Q8N0X2 631 aa16.03■□□□□ 0.16
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PPARG-202ENST00000309576 TIMM23O14925 209 aa16.03■□□□□ 0.16
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PPARG-202ENST00000309576 CASTOR1Q8WTX7 329 aa16.03■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 MITD1Q8WV92 249 aa16.03■□□□□ 0.16
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PPARG-202ENST00000309576 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa16.02■□□□□ 0.16
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PPARG-202ENST00000309576 CDS2O95674 445 aa16.02■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa16.02■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 TMEM56Q96MV1 263 aa16.02■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 MEGF9Q9H1U4 602 aa16.02■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa16.02■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa16.02■□□□□ 0.16
PPARG-202ENST00000309576 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.15
PPARG-202ENST00000309576 IGKV1-39P01597 117 aa16.01■□□□□ 0.15
PPARG-202ENST00000309576 IGKV1D-39P04432 117 aa16.01■□□□□ 0.15
PPARG-202ENST00000309576 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa16.01■□□□□ 0.15
PPARG-202ENST00000309576 IL17RELQ6ZVW7 336 aa16.01■□□□□ 0.15
PPARG-202ENST00000309576 MOB3BQ86TA1 216 aa16.01■□□□□ 0.15
PPARG-202ENST00000309576 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PPARG-202ENST00000309576 TMEM160Q9NX00 188 aa16.01■□□□□ 0.15
PPARG-202ENST00000309576 MTORP42345 2549 aa16.01■□□□□ 0.15
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