RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 PGPA6NDG6 321 aa11.7□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 BTCP35070 178 aa11.7□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 ATG101Q9BSB4 218 aa11.7□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM208Q9BTX3 173 aa11.7□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMIM12Q96EX1 92 aa11.7□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 MED12Q93074 2177 aa11.7□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 DCAF10Q5QP82 559 aa11.7□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa11.7□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 KBTBD11O94819 623 aa11.7□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 CBLN1P23435 193 aa11.7□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 C1orf53Q5VUE5 145 aa11.7□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa11.7□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.7□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 MPV17P39210 176 aa11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 NUBP1P53384 320 aa11.69□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ABHD12Q8N2K0 398 aa11.69□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF645Q8N7E2 425 aa11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 S1PR2O95136 353 aa11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 HIGD1AQ9Y241 93 aa11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 MARCH11A6NNE9 402 aa11.69□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 KIF26BQ2KJY2 2108 aa11.69□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.69□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 C12orf54Q6X4T0 127 aa11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 PGLYRP4Q96LB8 373 aa11.68□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 C1orf210Q8IVY1 113 aa11.68□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 K7N7A8 449 aa11.68□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 LAMB2P55268 1798 aa11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 CLDN18P56856 261 aa11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM183AQ8IXX5 376 aa11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 NEU1Q99519 415 aa11.68□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa11.68□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF735P0CB33 412 aa11.67□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 M0R3E3 92 aa11.67□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 SLC25A34Q6PIV7 304 aa11.67□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 RAMP1O60894 148 aa11.67□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 TMEM45BQ96B21 275 aa11.67□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
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TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM90A18PA6NE21 464 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM90A16PA6NEW6 464 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM90A7PA6NKC0 464 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM90A22PA8MWA6 464 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM90A12PA8MX19 464 aa11.66□□□□□ -0.54
TRAPPC10-201ENST00000291574 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa11.66□□□□□ -0.54
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