RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 PTTG1IPP53801 180 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 TMEM54Q969K7 222 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 GALMQ96C23 342 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 DLL3Q9NYJ7 618 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 OR7C2O60412 319 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 PTGDSP41222 190 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 UCP2P55851 309 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 AGBL5Q8NDL9 886 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 OR6C3Q9NZP0 311 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 A0A1W2PR77 199 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 FCGR3BO75015 233 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 S100A7P31151 101 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 PAX9P55771 341 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 ABHD17BQ5VST6 288 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 C20orf204Q6ZNR8 217 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 SMRP1Q8NCR6 262 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 DEFB127Q9H1M4 99 aa13.01□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 ZIC4Q8N9L1 334 aa13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 TMEM68Q96MH6 324 aa13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 ZNF391Q9UJN7 358 aa13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 FREM2Q5SZK8 3169 aa13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 CTSSP25774 331 aa13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 OR52L2PQ8NGH6 319 aa13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 TMEM170AQ8WVE7 144 aa13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 EYSQ5T1H1 3165 aa13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 OR1L6Q8NGR2 347 aa13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 HIPK2Q9H2X6 1198 aa13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 SEMA5BQ9P283 1151 aa13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 B4GALT7Q9UBV7 327 aa13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 PPIAL4AQ9Y536 164 aa13□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 SH2D1BO14796 132 aa12.99□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 ZNF253O75346 499 aa12.99□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 LTBRP36941 435 aa12.99□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 AESQ08117 197 aa12.99□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 LINC00205P59089 165 aa12.99□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 DRAM1Q8N682 238 aa12.99□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 STARD4Q96DR4 205 aa12.99□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 TPPP3Q9BW30 176 aa12.99□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa12.99□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 A0A1W2PQM1 296 aa12.99□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 S1PR2O95136 353 aa12.99□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 CRYGSP22914 178 aa12.99□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 OR1L1Q8NH94 360 aa12.99□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 RAMP3O60896 148 aa12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 RAB31Q13636 194 aa12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 CEACAM21Q3KPI0 293 aa12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 TECTBQ96PL2 329 aa12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 C20orf202A1L168 122 aa12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 DIRC3C9JPN6 131 aa12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 IRF2P14316 349 aa12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 FXYD3Q14802 87 aa12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 WNT10AQ9GZT5 417 aa12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 VAMP3Q15836 100 aa12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 LYSMD4Q5XG99 296 aa12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 SGK494Q96LW2 274 aa12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 RTL8AQ9BWD3 113 aa12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 FOXJ2Q9P0K8 574 aa12.98□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 IGKV1D-33P01593 117 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 IGKV1-33P01594 117 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 NPSP0C0P6 89 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 RND2P52198 227 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 HIST3H3Q16695 136 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 MIC13Q5XKP0 118 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 OR8I2Q8N0Y5 310 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 OR5A2Q8NGI9 324 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 DUSP23Q9BVJ7 150 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 PLSCR2Q9NRY7 297 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 PFN1P07737 140 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 ADMP35318 185 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 CXCL12P48061 93 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 CAMPP49913 170 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 NHLRC2Q8NBF2 726 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 SSC4DQ8WTU2 575 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 DECR2Q9NUI1 292 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 TMEM250H0YL14 139 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 SERF1AO75920 110 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 MT-CO2P00403 227 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 IGKV1-5P01602 117 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 ZNF826PQ6ZT77 177 aa12.97□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 B4E171 279 aa12.96□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 TSPAN7P41732 249 aa12.96□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 CRIP3Q6Q6R5 217 aa12.96□□□□□ -0.33
USP25-201ENST00000285679 VPS25Q9BRG1 176 aa12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.6 ms