RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264828.3

COL5A3-201, Transcript of collagen type V alpha 3 chain, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COL5A3, Length 6,174 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A3-201ENST00000264828 TLNRD1Q9H1K6 362 aa15.5■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 MT-ND6P03923 174 aa15.5■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 C1orf185Q5T7R7 199 aa15.5■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 ITLN1Q8WWA0 313 aa15.5■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 SCN4AP35499 1836 aa15.5■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 DDTP30046 118 aa15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 UQCR10Q9UDW1 63 aa15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 RND2P52198 227 aa15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 RRN3P1Q2M238 152 aa15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 PF4V1P10720 104 aa15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 FGFRL1Q8N441 504 aa15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 AQP3Q92482 292 aa15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 MAP1LC3AQ9H492 121 aa15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 MGST3O14880 152 aa15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 ZG16O60844 167 aa15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 SLC25A38Q96DW6 304 aa15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 DDA1Q9BW61 102 aa15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 RND3P61587 244 aa15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM45BQ96B21 275 aa15.49■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 CD1AP06126 327 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 ANOS1P23352 680 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 CRYBB3P26998 211 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 FUT5Q11128 374 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 GCSAMLQ5JQS6 135 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 IGHV4-34P06331 123 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 DLX6P56179 175 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 RPL8P62917 257 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 CX3CL1P78423 397 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 PMCHL1Q16048 86 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 WDR54Q9H977 334 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 SCN3AQ9NY46 2000 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 HLA-DQA1P01909 254 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 NAT2P11245 290 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 FCARP24071 287 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa15.48■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM229AB2RXF0 380 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 NPIPB8E9PQR5 432 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 PRSS2P07478 247 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 C12orf54Q6X4T0 127 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 AGAP20933 346 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 FHITP49789 147 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 H2BFSP57053 126 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 MPV17P39210 176 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 SLC25A34Q6PIV7 304 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 GCSAMQ8N6F7 178 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 MPDU1O75352 247 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 OR11H4Q8NGC9 324 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 IGHV3-48P01763 117 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM136Q6ZRR5 245 aa15.47■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 NINQ8N4C6 2090 aa15.46■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 Q5BKY6 102 aa15.46■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 A0A1B0GV90 55 aa15.46■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 SLC25A17O43808 307 aa15.46■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 S1PR2O95136 353 aa15.46■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa15.46■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 C5orf66Q9H5L9 145 aa15.46■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa15.46■□□□□ 0.07
COL5A3-201ENST00000264828 TRGC1P0CF51 173 aa15.46■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 NPIPB6E9PJ23 425 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 FOLR2P14207 255 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 PRF1P14222 555 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 PMS2CLQ68D20 193 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 OR51M1Q9H341 326 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 A0A0B4J293 547 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 NGFRP08138 427 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 LDLRAD4O15165 306 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 FAM106CPP0CH98 169 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 SMAGPQ0VAQ4 97 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 TMEM171Q8WVE6 324 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 AQP10Q96PS8 301 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 IFITM2Q01629 132 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 WNT5BQ9H1J7 359 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 SMCHD1A6NHR9 2005 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa15.45■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 KLRB1Q12918 225 aa15.44■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 TTC32Q5I0X7 151 aa15.44■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 BIVMQ86UB2 503 aa15.44■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 KCNK17Q96T54 332 aa15.44■□□□□ 0.06
COL5A3-201ENST00000264828 DLL3Q9NYJ7 618 aa15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms