RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 CHODLQ9H9P2 273 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 RNF7Q9UBF6 113 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 HERPUD1Q15011 391 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 RPEL1Q2QD12 228 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 OR1P1Q8NH06 330 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 RP1P56715 2156 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 TRGC1P0CF51 173 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 GNB2P62879 340 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 FAM162BQ5T6X4 162 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 TEPPQ6URK8 271 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 RAB24Q969Q5 203 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 ODAMA1E959 279 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 MARCH11A6NNE9 402 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 SPRY3O43610 288 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 ZG16O60844 167 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 LCN2P80188 198 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 RNF151Q2KHN1 245 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 FZR1Q9UM11 496 aa7.47□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 DVL1O14640 695 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 NDUFB7P17568 137 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 ZNF83P51522 516 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.46□□□□□ -1.21
HERC3-201ENST00000264345 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 IGHV1-2P23083 117 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CHRNA7P36544 502 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CASP6P55212 293 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 RBPJQ06330 500 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 MDS2Q8NDY4 140 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 PARLQ9H300 379 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 NPY1RP25929 384 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 SPINK9Q5DT21 86 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 IL17BQ9UHF5 180 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PN81 502 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 PHOX2AO14813 284 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 SPINK2P20155 84 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 MPV17P39210 176 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 PSG7Q13046 419 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 TGIF1Q15583 401 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 LYG1Q8N1E2 194 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 DIRC2Q96SL1 478 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 RNF115Q9Y4L5 304 aa7.46□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 OPRK1P41145 380 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 GNG4P50150 75 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 RPS16P62249 146 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 PXMP4Q9Y6I8 212 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CD99P14209 185 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 MAS1LP35410 378 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 SSTP61278 116 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 VSTM2AQ8TAG5 236 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 ZNHIT1O43257 154 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 IGKV1-5P01602 117 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 NTF4P34130 210 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 ERVFC1-1P60608 527 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 PMS2P11Q13670 270 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 ZNF826PQ6ZT77 177 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 SLC24A4Q8NFF2 622 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 OR52E5Q8NH55 327 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 MSL2Q9HCI7 577 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa7.45□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 OR7C2O60412 319 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 IL18BPO95998 194 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 ANOS1P23352 680 aa7.44□□□□□ -1.22
HERC3-201ENST00000264345 S100A7P31151 101 aa7.44□□□□□ -1.22
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