RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637015.1

ARID1B-223, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene ARID1B, Length 5,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-223	ENST00000637015	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	CSRP2	Q16527	193 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	CHODL	Q9H9P2	273 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	COX6A1	P12074	109 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		10.66	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015		A0A1W2PPE3	182 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	KBTBD11	O94819	623 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	IGHM	P01871	453 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	NPPC	P23582	126 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	CKS2	P33552	79 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF137P	P52743	207 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	MFAP2	P55001	183 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	TTC3	P53804	2025 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	PRR19	A6NJB7	356 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015		H7C1H1	209 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF146	Q15072	292 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	KCNAB3	O43448	404 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	PPP1R17	O96001	155 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	CD74	P04233	296 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	ANOS1	P23352	680 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
ARID1B-223	ENST00000637015	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	LIMS1	P48059	325 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TFPI2	P48307	235 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TCF24	Q7RTU0	167 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF488	Q96MN9	340 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	C8orf88	P0DMB2	117 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	GZMM	P51124	257 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	CX3CL1	P78423	397 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	GUCD1	Q96NT3	240 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TBX15	Q96SF7	602 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TMEM140	Q9NV12	185 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	PRR13	Q9NZ81	148 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015		A0A0G2JLM5	398 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	APELA	P0DMC3	54 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	PMCHL1	Q16048	86 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	RBKS	Q9H477	322 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC25A45	Q8N413	288 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	JMJD8	Q96S16	334 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	RND2	P52198	227 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	COTL1	Q14019	142 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		10.64	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015		H3BVH4	76 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	DYRK2	Q92630	601 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SOST	Q9BQB4	213 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	RSG1	Q9BU20	258 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	LINC00862	A6NCI5	91 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	OR4C46	A6NHA9	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	TM4SF5	O14894	197 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	10.63	□□□□□ -0.71	7e-9	■■■■□ 20.9
ARID1B-223	ENST00000637015	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	FAM209B	Q5JX69	171 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	COL18A1	P39060	1754 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	PGP	A6NDG6	321 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	NRN1L	Q496H8	165 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	C10orf128	Q5T292	105 aa		10.63	□□□□□ -0.71
ARID1B-223	ENST00000637015	KIR2DL4	Q99706	377 aa		10.63	□□□□□ -0.71

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